More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1104 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  91.3 
 
 		 208 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  90.82 
 
 		 208 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  89.86 
 
 		 206 aa  391  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  67.96 
 
 		 215 aa  304  8.000000000000001e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  58.5 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  59.5 
 
 		 226 aa  250  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  54.23 
 
 		 214 aa  245  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  51.34 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  49.75 
 
 		 199 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  48.39 
 
 		 263 aa  189  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  48.39 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  45.63 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  49.15 
 
 		 268 aa  187  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  45.65 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  47.26 
 
 		 205 aa  185  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  45.9 
 
 		 259 aa  184  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  47.13 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  42.79 
 
 		 220 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  47.49 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  46.93 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  41.79 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  41.79 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  44.44 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  42.71 
 
 		 220 aa  175  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  43.55 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  44.95 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  40.96 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  41.94 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  40.11 
 
 		 261 aa  149  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  41.24 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  37.57 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.63 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  40.48 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  37.93 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  24.28 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  25.63 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  24.79 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  40.7 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  39.77 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  24.22 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  23.56 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  25.89 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  27.01 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  23.53 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  32.74 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  23.53 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  25.89 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  37 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  23.11 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  45.59 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1210  30S ribosomal protein S2  45.31 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  37.65 
 
 		 257 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  26.24 
 
 		 276 aa  62  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  25.79 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  40.24 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  45.59 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  44.58 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  22.67 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  26.34 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  37 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  23.53 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf061  30S ribosomal protein S2  25.31 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.838903  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  35.85 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  26.01 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  41.03 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  24.89 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  38.1 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  25.89 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  43.75 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  35.29 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  34.29 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  26.54 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0007  ribosomal protein S2  26.55 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  35.29 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  24.68 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  25.68 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  40.91 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2353  30S ribosomal protein S2  38.37 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  34.12 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  34.65 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  24.35 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  36.11 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  36.11 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  24.35 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  26.79 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  23.64 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  23.18 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0532  30S ribosomal protein S2  24.76 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00675401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1534  ribosomal protein S2  35.53 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1343  30S ribosomal protein S2  35.53 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  39.02 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  23.72 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  23.18 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  40.58 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  24.2 
 
 		 301 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>