56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1081 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  100 
 
 
80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  95 
 
 
80 aa  158  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  92.5 
 
 
80 aa  156  9e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  92.41 
 
 
80 aa  154  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  53.95 
 
 
79 aa  85.9  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  56.92 
 
 
75 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.133876 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  54.29 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  50 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  46.88 
 
 
72 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  47.69 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  50.88 
 
 
76 aa  66.6  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  49.12 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  49.12 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  51.56 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  46.88 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  41.27 
 
 
71 aa  62.8  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  41.54 
 
 
75 aa  60.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  43.86 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  48.44 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  39.06 
 
 
81 aa  53.5  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  45.31 
 
 
71 aa  52.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  46.97 
 
 
87 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  41.27 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39384  predicted protein  42.86 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.447648  normal  0.30848 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  35.06 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.88 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  42.42 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.36 
 
 
74 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  41.94 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  39.34 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  37.31 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  33.78 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  42.86 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  33.33 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  36.49 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  39.68 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  35.94 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  45.16 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  40.32 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  39.68 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.38 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  34.33 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68190  predicted protein  32.56 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502273  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  43.94 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  39.66 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  35.53 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  31.25 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  43.75 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  36.92 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  36.76 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.92 
 
 
72 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  36.92 
 
 
72 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  29.73 
 
 
95 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 
60 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  31.58 
 
 
287 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  36.92 
 
 
72 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>