34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1077 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  100 
 
 
149 aa  298  2e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  64.9 
 
 
152 aa  196  7e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  59.31 
 
 
163 aa  183  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  59.71 
 
 
148 aa  174  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1534  PUA domain-containing protein  38.24 
 
 
157 aa  94  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.305531  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.56 
 
 
649 aa  67  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  28.77 
 
 
606 aa  67  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  30.43 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.82 
 
 
652 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  27.86 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.86 
 
 
649 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  32.39 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  32.17 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  29.05 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.46 
 
 
649 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.35 
 
 
649 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  34.43 
 
 
184 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  27.5 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  27.46 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  31.96 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  28.67 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  31.03 
 
 
165 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  28.33 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  31.45 
 
 
165 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  27.59 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  30.25 
 
 
633 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  32.14 
 
 
172 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  29.63 
 
 
189 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  25.58 
 
 
634 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  27.97 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0394  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.25 
 
 
398 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0312752  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  32.56 
 
 
176 aa  40.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  30.77 
 
 
472 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  28.57 
 
 
153 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>