27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1074 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  100 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  90 
 
 		 170 aa  322  2e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  80 
 
 		 170 aa  299  1e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  75.29 
 
 		 170 aa  274  5e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1388  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.9 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  32.65 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  27.21 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  29.27 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.933385 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  26.12 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.77 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.14 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  22.54 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  21.95 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  26.81 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.79 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  21.54 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  21.95 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  23.62 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  23.58 
 
 		 211 aa  47.8  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  21.93 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  23.36 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  23 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 500 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  37.18 
 
 		 502 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  24.03 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  21.95 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.3 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>