143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1024 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
403 aa  820    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  75.68 
 
 
415 aa  653    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  77.25 
 
 
416 aa  653    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  75.19 
 
 
416 aa  629  1e-179  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  28.5 
 
 
394 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
378 aa  99.4  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
390 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
394 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
388 aa  93.2  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.04 
 
 
386 aa  92  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
390 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  26.96 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.48 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.28 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.28 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.28 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.28 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.28 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.48 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.28 
 
 
383 aa  77  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
378 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.15 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
398 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
398 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  22.85 
 
 
373 aa  63.2  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 
393 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
396 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 
394 aa  60.1  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 
500 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 
496 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 
500 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
401 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
385 aa  57.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 
392 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
387 aa  56.6  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3845  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  22.96 
 
 
399 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 
817 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 
806 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
393 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
376 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 
492 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 
400 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 
805 aa  53.5  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0785769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
797 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  23.57 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
423 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 
383 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 
441 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 
804 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
365 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 
378 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.75 
 
 
418 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 
806 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  26.11 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  23.12 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  22.63 
 
 
806 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.6 
 
 
428 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  21.88 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 
583 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 
365 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  24.52 
 
 
372 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>