170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0972 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  75.16 
 
 
475 aa  717    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  100 
 
 
472 aa  950    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  71.15 
 
 
473 aa  660    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  70.13 
 
 
474 aa  710    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.56 
 
 
484 aa  374  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  46.79 
 
 
416 aa  325  9e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.49 
 
 
500 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.76 
 
 
493 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.53 
 
 
371 aa  261  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  36.76 
 
 
502 aa  249  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  35.79 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.96 
 
 
482 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.1 
 
 
390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.5 
 
 
482 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.95 
 
 
482 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.95 
 
 
482 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.64 
 
 
482 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.95 
 
 
482 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.95 
 
 
482 aa  210  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.06 
 
 
483 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.06 
 
 
483 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.06 
 
 
483 aa  210  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.72 
 
 
482 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.72 
 
 
482 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.49 
 
 
482 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 
482 aa  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  39.59 
 
 
335 aa  207  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.26 
 
 
482 aa  207  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.18 
 
 
482 aa  207  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.26 
 
 
482 aa  207  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  33.18 
 
 
482 aa  207  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.18 
 
 
482 aa  207  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.26 
 
 
482 aa  206  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.56 
 
 
515 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.49 
 
 
482 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.81 
 
 
380 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.99 
 
 
370 aa  203  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.1 
 
 
482 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.99 
 
 
496 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.24 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  35.29 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.41 
 
 
484 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.44 
 
 
361 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.74 
 
 
482 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.94 
 
 
484 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  33.85 
 
 
387 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.66 
 
 
400 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.34 
 
 
484 aa  189  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.98 
 
 
465 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.65 
 
 
484 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.02 
 
 
484 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.65 
 
 
484 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.9 
 
 
392 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.1 
 
 
484 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.1 
 
 
484 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.1 
 
 
484 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.1 
 
 
484 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.27 
 
 
484 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.25 
 
 
484 aa  186  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.59 
 
 
484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.12 
 
 
486 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.54 
 
 
482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.17 
 
 
484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.41 
 
 
483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.99 
 
 
484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.75 
 
 
484 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.17 
 
 
484 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.28 
 
 
485 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.55 
 
 
484 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.55 
 
 
484 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.64 
 
 
392 aa  183  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.33 
 
 
484 aa  183  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.03 
 
 
484 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.39 
 
 
413 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.41 
 
 
484 aa  179  8e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.72 
 
 
398 aa  177  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.3 
 
 
478 aa  177  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  33.88 
 
 
404 aa  177  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.45 
 
 
484 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  31.7 
 
 
484 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.58 
 
 
414 aa  176  8e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.31 
 
 
484 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.24 
 
 
383 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.55 
 
 
484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.7 
 
 
515 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.74 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.29 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.43 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.84 
 
 
407 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.29 
 
 
385 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.85 
 
 
383 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.43 
 
 
385 aa  169  7e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.69 
 
 
392 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.66 
 
 
483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.68 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.36 
 
 
402 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.97 
 
 
429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.6 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.14 
 
 
414 aa  166  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>