More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0647 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
96 aa  203  5e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.512756  hitchhiker  0.00122416 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2370  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  92.71 
 
 
96 aa  193  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  92.71 
 
 
96 aa  191  3e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  81.91 
 
 
96 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.5 
 
 
98 aa  127  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000449419  decreased coverage  0.000160818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1433  putative ferredoxin like protein; FixX  47.96 
 
 
99 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102242  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0061  ferredoxin  48.89 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2316  putative ferredoxin like protein; FixX  45.92 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00117269  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1477  ferredoxin-like protein  48.35 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1193  putative ferredoxin like protein; FixX  48.35 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.170567 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7736  putative ferredoxin like protein; FixX  45.65 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10550  FixX ferredoxin-like protein  47.78 
 
 
94 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0834352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1371  putative ferredoxin like protein; FixX  46.74 
 
 
98 aa  90.1  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.19 
 
 
92 aa  89.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.16 
 
 
95 aa  87.8  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1541  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1259  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.07 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4603  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  40.22 
 
 
93 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3926  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.11 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.540804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.46 
 
 
111 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.362888  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.16 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0490  putative ferredoxin protein, FixX  44.44 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.22 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3574  ferredoxin-like protein  43.62 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.183526  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6231  FixX ferredoxin-like protein  41.11 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1552  ferredoxin-like protein  43.96 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281745  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1938  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 
106 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0139  putative ferredoxin protein, FixX  41.11 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4012  ferredoxin-like protein  40.43 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.89 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.47 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2264  ferredoxin  41.11 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0290114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.36 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1091  ferredoxin like protein, fixX  38.54 
 
 
98 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4926  FixX ferredoxin-like protein  37.78 
 
 
98 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0987  ferredoxin like protein, fixX  37.78 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0910173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3613  putative ferredoxin protein, FixX  36.08 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5869  putative ferredoxin protein, FixX  36.67 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.04 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4445  ferredoxin like protein, fixX  37.5 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5083  putative ferredoxin protein, FixX  36.67 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2123  hypothetical protein  32.99 
 
 
94 aa  60.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0589  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.65 
 
 
89 aa  60.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000249296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0484  monooxygenase FAD-binding protein  32.04 
 
 
561 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35565  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3861  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  29.9 
 
 
96 aa  57.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00147528  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2680  putative ferredoxin  34.07 
 
 
95 aa  57.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1844  putative ferredoxin  30.77 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.148081  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3233  putative ferredoxin  32.97 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2197  iron-sulfur cluster-binding protein FixX  33.7 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4042  putative ferredoxin  34.07 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00048  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  32.97 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3555  putative ferredoxin  32.97 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0050  ferredoxin homolog FixX  32.97 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3611  putative ferredoxin  32.97 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00047  hypothetical protein  32.97 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0048  ferredoxin homolog FixX  32.97 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0046  ferredoxin homolog FixX  32.97 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.922786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0048  ferredoxin homolog FixX  32.97 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0575  hypothetical protein  32.61 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27810  ferredoxin-like protein  31.68 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  34.04 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1917  iron-sulfur cluster-binding protein  34.04 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1903  iron-sulfur cluster-binding protein  34.04 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1495  iron-sulfur cluster-binding protein  34.04 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.306818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.588767  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0085  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.807465  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1435  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.96 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0087  ferredoxin-like protein ydiT  33.33 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1398  ferredoxin-like protein  32.97 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0672004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.951067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01669  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  32.98 
 
 
97 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01658  hypothetical protein  32.98 
 
 
97 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09260  ferredoxin-like protein  36.26 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.759582 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1993  ferredoxin like protein  30.85 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0887759  normal  0.0253227 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1942  iron-sulfur cluster-binding protein  32.98 
 
 
97 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.332806  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  40.43 
 
 
667 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1481  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  30.85 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0731484 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1821  putative ferredoxin  30.85 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1028  putative ferredoxin  27.47 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1931  hypothetical protein  32.98 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0527008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1447  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  30.85 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.128489 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.3 
 
 
671 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 
491 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0314  putative ferredoxin  31.87 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2812  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 
490 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.75 
 
 
180 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0122897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.75 
 
 
180 aa  50.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3065  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.25 
 
 
571 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1463  ferredoxin like protein  30.85 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02612  predicted 4Fe-4S cluster-containing protein  36.9 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08760  ferredoxin-like protein  30.11 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.696801 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.31 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.149378  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0945  hypothetical protein  36.9 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02575  hypothetical protein  36.9 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1274  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.68 
 
 
630 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0623  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30 
 
 
548 aa  48.1  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>