30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0599 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  77.13 
 
 		 411 aa  692    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  100 
 
 		 413 aa  834    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  68.13 
 
 		 411 aa  607  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  64.96 
 
 		 411 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  36.75 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  33.72 
 
 		 431 aa  202  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  32.61 
 
 		 401 aa  202  8e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  35.48 
 
 		 383 aa  199  7e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  31.22 
 
 		 438 aa  196  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  32.68 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  32.18 
 
 		 470 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  32.86 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  31.38 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  31.68 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  30.43 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  31.72 
 
 		 410 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  32.11 
 
 		 452 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  29.61 
 
 		 474 aa  177  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  29.22 
 
 		 415 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  29.56 
 
 		 409 aa  176  9e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  30.82 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  29.56 
 
 		 411 aa  169  8e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  30.25 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  29.57 
 
 		 453 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  34.38 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0532  pseudouridylate synthase-like protein  25.36 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45108  predicted protein  27.93 
 
 		 571 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29419  predicted protein  29.46 
 
 		 276 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.444552  hitchhiker  0.00250662 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  29.32 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.293188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>