69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0519 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  441  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  80.09 
 
 
221 aa  366  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  70.59 
 
 
221 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  75.11 
 
 
221 aa  299  3e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  49.54 
 
 
236 aa  187  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  43.78 
 
 
224 aa  156  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  42.72 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  44.21 
 
 
213 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  44.77 
 
 
216 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  33.33 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  30.19 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  29.95 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  29.9 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  30.12 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  32.06 
 
 
230 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  30.15 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  25.76 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  28 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  31.31 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  30.53 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  32.06 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  27.13 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  26.29 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  27.88 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  26.11 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  27.45 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  27.62 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  31.52 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  28.28 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  28.24 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  31.85 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  28.9 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  27.44 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0592  B3/4 domain protein  34.07 
 
 
232 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.557641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  27.4 
 
 
235 aa  58.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  26.09 
 
 
218 aa  58.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  31.88 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  28.15 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  24.62 
 
 
240 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  28.91 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  26.09 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  26.09 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  26.09 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  25.5 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  25.97 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  26.09 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0871  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.33 
 
 
801 aa  49.7  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.23087  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  24.14 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1284  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.08 
 
 
791 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4096  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.73 
 
 
799 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0065  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.82 
 
 
812 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.145265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3155  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.1 
 
 
806 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02093  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.85 
 
 
806 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1838  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.81 
 
 
810 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0684561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003705  phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain  28.85 
 
 
801 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.374236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1306  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  31.43 
 
 
810 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.927981  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.68 
 
 
797 aa  46.2  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.32 
 
 
795 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.468133  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  37.21 
 
 
222 aa  45.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5318  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.74 
 
 
808 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0273897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  40 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1816  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.56 
 
 
819 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.597533  normal  0.483495 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  23.03 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0918  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  27.62 
 
 
807 aa  42.4  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5551  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.09 
 
 
808 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1875  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.25 
 
 
813 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0221  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.73 
 
 
812 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0448  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.71 
 
 
818 aa  41.6  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0280  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.18 
 
 
807 aa  41.6  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>