More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0302 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  62.68 
 
 
702 aa  857    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  71.94 
 
 
702 aa  988    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  60.4 
 
 
700 aa  801    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  100 
 
 
702 aa  1378    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  31.59 
 
 
804 aa  145  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  24.35 
 
 
858 aa  144  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  24.7 
 
 
693 aa  139  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  25.27 
 
 
864 aa  99.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  23.37 
 
 
802 aa  89  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  27.4 
 
 
1074 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  24.11 
 
 
805 aa  85.5  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  25.75 
 
 
1061 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  30.7 
 
 
902 aa  83.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  24.73 
 
 
993 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  26.86 
 
 
895 aa  82  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  25.73 
 
 
994 aa  81.3  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.68 
 
 
1191 aa  80.5  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  25.15 
 
 
790 aa  80.1  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  27.72 
 
 
794 aa  79.3  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.39 
 
 
993 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  24.81 
 
 
1019 aa  78.6  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  25.93 
 
 
993 aa  77.4  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  24.26 
 
 
935 aa  76.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  25.97 
 
 
891 aa  73.9  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  26.25 
 
 
924 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  23.45 
 
 
891 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  28.91 
 
 
1057 aa  71.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  23.39 
 
 
813 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  22.5 
 
 
1021 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  23.61 
 
 
784 aa  68.6  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  25.56 
 
 
795 aa  68.2  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  22.83 
 
 
1125 aa  66.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  25.94 
 
 
890 aa  65.1  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.59 
 
 
926 aa  63.9  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  58.7 
 
 
922 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  29.97 
 
 
1082 aa  62.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  28.62 
 
 
1171 aa  62  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.66 
 
 
1174 aa  62  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  24.16 
 
 
1114 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  21.58 
 
 
1016 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  32.89 
 
 
1038 aa  61.2  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  31.96 
 
 
1076 aa  60.8  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  29.25 
 
 
789 aa  60.1  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  26.42 
 
 
1146 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  24.39 
 
 
1007 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  28.93 
 
 
953 aa  58.5  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  30.72 
 
 
677 aa  58.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  21.99 
 
 
1008 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  35.16 
 
 
814 aa  57.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  26.11 
 
 
1003 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1198 aa  57.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  22.75 
 
 
1063 aa  57.4  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  21.99 
 
 
1008 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  26.03 
 
 
1060 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  23.04 
 
 
859 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  22.13 
 
 
859 aa  56.6  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  23.89 
 
 
978 aa  56.6  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  26.99 
 
 
1146 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  32.74 
 
 
225 aa  55.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  40 
 
 
238 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  24.66 
 
 
875 aa  55.5  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  22.96 
 
 
1019 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  52.63 
 
 
370 aa  54.7  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  46.75 
 
 
243 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  22.99 
 
 
483 aa  54.3  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  33.33 
 
 
987 aa  54.3  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  38.03 
 
 
912 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  22.94 
 
 
859 aa  54.3  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  27.45 
 
 
852 aa  53.9  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  42.86 
 
 
302 aa  53.9  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  27.45 
 
 
852 aa  53.9  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 
248 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  32.73 
 
 
1189 aa  53.5  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  25 
 
 
888 aa  53.9  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  39.74 
 
 
238 aa  53.9  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0257  ATP-binding protein  43.75 
 
 
248 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000197314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0186  ABC transporter related  40.51 
 
 
244 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.475038 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  42.86 
 
 
302 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  45.45 
 
 
246 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  26.95 
 
 
812 aa  52.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  32.73 
 
 
1189 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  31.5 
 
 
1179 aa  52.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
302 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  32.73 
 
 
1189 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18310  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydD  42.67 
 
 
584 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120639  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  26.04 
 
 
514 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  32.73 
 
 
1189 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  42.86 
 
 
302 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  44.16 
 
 
247 aa  52.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  40.28 
 
 
339 aa  52.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30460  structural maintenance of chromosomes protein  26.27 
 
 
1093 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.157057 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1000  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  38.46 
 
 
242 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  23.8 
 
 
961 aa  52.4  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  26.47 
 
 
1147 aa  52.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  33.33 
 
 
1187 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  37.38 
 
 
300 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.79 
 
 
1178 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  31.82 
 
 
1189 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  23.26 
 
 
1170 aa  52  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0929  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  38.46 
 
 
242 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.285427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>