More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0231 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  100 
 
 		 723 aa  1447    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  97.79 
 
 		 723 aa  1419    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  28.19 
 
 		 682 aa  180  8e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  27.73 
 
 		 682 aa  178  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  31.87 
 
 		 478 aa  104  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.79 
 
 		 483 aa  102  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  25.94 
 
 		 318 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.95 
 
 		 318 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 322 aa  95.5  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  34.3 
 
 		 297 aa  95.5  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  34.3 
 
 		 299 aa  93.6  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.08 
 
 		 338 aa  90.1  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.08 
 
 		 338 aa  90.1  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  24.47 
 
 		 315 aa  90.1  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 341 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  24.87 
 
 		 375 aa  90.1  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 379 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  27.06 
 
 		 361 aa  89.7  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.47 
 
 		 315 aa  88.6  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 289 aa  88.6  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 307 aa  87.8  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 296 aa  86.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.84 
 
 		 356 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  25.23 
 
 		 335 aa  83.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 317 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  23.57 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  23.72 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  24.69 
 
 		 517 aa  81.3  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  27.9 
 
 		 312 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 322 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  28.08 
 
 		 311 aa  80.1  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.37 
 
 		 375 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 354 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.32 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  23.67 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.96 
 
 		 315 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 321 aa  77  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 328 aa  77  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  23.71 
 
 		 394 aa  76.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  26.73 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  29.09 
 
 		 323 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  25.07 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  26.67 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  25.16 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.32 
 
 		 315 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.32 
 
 		 315 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 396 aa  73.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3792  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 350 aa  73.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0976138  normal  0.756934 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  26.27 
 
 		 362 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 267 aa  73.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 377 aa  73.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4113  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23 
 
 		 317 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  28.17 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  21.94 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  21.79 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  28.25 
 
 		 296 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  22.98 
 
 		 384 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 369 aa  70.5  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.32 
 
 		 342 aa  70.1  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 287 aa  69.7  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.33 
 
 		 353 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  22.51 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  22.05 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  26.81 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  24.52 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  23.74 
 
 		 401 aa  67  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 370 aa  67  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.5 
 
 		 429 aa  67  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  23.16 
 
 		 378 aa  67.4  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 393 aa  66.6  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  23.71 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 333 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4216  periplasmic binding protein  22.04 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2195  periplasmic binding protein  31.22 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0123698  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  23.03 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>