49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0177 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 
302 aa  606  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  96.36 
 
 
302 aa  570  1e-161  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  57.78 
 
 
277 aa  321  9.000000000000001e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1445  nitrate reductase, gamma subunit  39.39 
 
 
302 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  36.68 
 
 
299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0840  Nitrate reductase gamma subunit  38.69 
 
 
312 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000098802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  29.48 
 
 
220 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  27.32 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  25.1 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  24.81 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  21.95 
 
 
332 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  24.91 
 
 
335 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  23.74 
 
 
330 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  23.75 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  25.3 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  26.19 
 
 
244 aa  49.7  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  22.22 
 
 
331 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  24.9 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  30.51 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1758  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  27.2 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  22.08 
 
 
334 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  22.44 
 
 
271 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.61 
 
 
254 aa  46.2  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  21.37 
 
 
233 aa  45.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1581  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  26.4 
 
 
226 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.214627  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1697  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  26.4 
 
 
226 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1762  respiratory nitrate reductase 2 gamma subunit  26.4 
 
 
226 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1695  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  25.6 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.953876 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2065  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.81 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  29.91 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  29.91 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.12 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  29.91 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.91 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.91 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.995386 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2182  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.8 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.292963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01435  hypothetical protein  24.8 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.35 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2075  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  24.8 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2191  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.8 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1646  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.8 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1549  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.8 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01423  nitrate reductase 2 (NRZ), gamma subunit  24.8 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  22.34 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1709  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  27.2 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.996367  normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.97 
 
 
225 aa  43.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.46 
 
 
225 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  28.28 
 
 
219 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.57 
 
 
233 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>