More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0088 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  100 
 
 
140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  91.18 
 
 
139 aa  247  5e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  80.58 
 
 
146 aa  229  8.000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  76.52 
 
 
143 aa  215  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 
139 aa  143  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
143 aa  128  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 
142 aa  120  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 
143 aa  118  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  47.52 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
148 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
142 aa  100  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
144 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 
583 aa  92.8  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.59 
 
 
577 aa  86.3  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  43.97 
 
 
424 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  34.78 
 
 
258 aa  67.4  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  32.81 
 
 
430 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
229 aa  63.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
302 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
311 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  31.11 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  36.63 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
311 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
268 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
311 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35.34 
 
 
317 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
303 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  37.11 
 
 
248 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
282 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  31.97 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  35.16 
 
 
305 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
174 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
172 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
315 aa  58.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
299 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
152 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
310 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  31.03 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  33 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 
237 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  41.24 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  41.24 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.91 
 
 
315 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  36.22 
 
 
365 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  41.24 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  35.96 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
166 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  41.24 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  41.24 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  35.85 
 
 
365 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  32.77 
 
 
181 aa  55.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  35.85 
 
 
365 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
301 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
130 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  40.21 
 
 
160 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  40.21 
 
 
160 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
211 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  36.07 
 
 
292 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  46.97 
 
 
343 aa  53.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  50 
 
 
156 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  40.21 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  50 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 
219 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  26.12 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>