More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0060 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  100 
 
 
272 aa  536  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  98.16 
 
 
272 aa  528  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  39.18 
 
 
281 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  35.77 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  36.1 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  37.31 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  41.58 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  41.22 
 
 
284 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  38.32 
 
 
282 aa  175  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  40.15 
 
 
283 aa  174  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  37.36 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  38.99 
 
 
281 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  33.09 
 
 
283 aa  169  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  36.8 
 
 
263 aa  169  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  41.24 
 
 
293 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  37.68 
 
 
334 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  41.64 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  37.45 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  39.29 
 
 
283 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  36.3 
 
 
263 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  38.41 
 
 
281 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  33.45 
 
 
279 aa  159  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  35.74 
 
 
272 aa  158  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  36.65 
 
 
290 aa  158  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  35.5 
 
 
270 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  34.83 
 
 
283 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  34.08 
 
 
283 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  37.13 
 
 
286 aa  151  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  42.32 
 
 
282 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  43.23 
 
 
277 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  36.63 
 
 
281 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  35.66 
 
 
285 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  40.82 
 
 
291 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  35.04 
 
 
279 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  31.88 
 
 
284 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  34.08 
 
 
283 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  32.72 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  37.36 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  43.23 
 
 
277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  39.57 
 
 
291 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  43.88 
 
 
512 aa  142  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  37.45 
 
 
284 aa  142  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.08 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  35.02 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  40 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.78 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  40.37 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  34.81 
 
 
275 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.23 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.23 
 
 
272 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  32.73 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1581  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.45 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.18 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.18 
 
 
270 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  39.86 
 
 
287 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.46 
 
 
275 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.2 
 
 
283 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2354  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  34.66 
 
 
277 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0647  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.2 
 
 
275 aa  123  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.173443  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34 
 
 
269 aa  123  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1237  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.15 
 
 
272 aa  122  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  40.91 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  30.69 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.7 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.69 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.74 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2646  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.43 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.306201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.8 
 
 
286 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.188879  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.2 
 
 
275 aa  112  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0685  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.86 
 
 
279 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.20191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0431  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.56 
 
 
285 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302379  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1184  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.21 
 
 
273 aa  112  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1146  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.72 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1382  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.21 
 
 
285 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00040191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  39.77 
 
 
286 aa  112  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  29.93 
 
 
280 aa  112  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.07 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.824148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4256  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.85 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000510657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.85 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2769  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.43 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0943247  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.4 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  34.19 
 
 
279 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2134  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.3 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27531  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  35.64 
 
 
297 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5465  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.69 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0160408  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0125  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.71 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.300128  normal  0.334676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  37.83 
 
 
847 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2248  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  35.04 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0133  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.27 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.539491  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0918  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.7 
 
 
276 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03770  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.4 
 
 
307 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797923  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.33 
 
 
285 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1263  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.79 
 
 
287 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0688  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.98 
 
 
277 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139091  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0786  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.09 
 
 
281 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.1 
 
 
277 aa  107  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1192  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.72 
 
 
286 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.672764  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0043  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.54 
 
 
297 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.541216  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1962  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32 
 
 
298 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.7 
 
 
283 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>