18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0056 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0056  egghead-like protein  100 
 
 
341 aa  679    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.350451  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0975  egghead-like protein  89.74 
 
 
341 aa  553  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2043  hypothetical protein  71.14 
 
 
341 aa  484  1e-135  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0138958 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1076  hypothetical protein  70.35 
 
 
346 aa  438  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0793139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6676  hypothetical protein  28.96 
 
 
444 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  30.38 
 
 
788 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  31.65 
 
 
778 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
549 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1771  hypothetical protein  24.08 
 
 
414 aa  47  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.91 
 
 
794 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
509 aa  46.2  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  30.38 
 
 
788 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.91 
 
 
811 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.65 
 
 
845 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.91 
 
 
804 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  30.38 
 
 
788 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  36.47 
 
 
428 aa  42.7  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.65 
 
 
810 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>