More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0055 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0055  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 428 aa  831    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0974  amino acid permease-associated region  87.71 
 
 		 438 aa  620  1e-176  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.11694 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  64.49 
 
 		 444 aa  543  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1335  amino acid permease-associated region  63.92 
 
 		 430 aa  502  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.654483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0779  amino acid permease-associated region  51.89 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.047573  normal  0.0991739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  30.8 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 455 aa  136  8e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  24.63 
 
 		 636 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  28.97 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  23.56 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  23.56 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 466 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 486 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  25.49 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  25.49 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  25.49 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  23.79 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  23.31 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  26.32 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  23.31 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  23.31 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24.91 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 518 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  23.37 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.91 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  23.08 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2910  UspA domain protein  27.15 
 
 		 649 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12405  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  28.12 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.49 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  26.32 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  26.32 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  26.32 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  26.58 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  26.32 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  26.32 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  26.32 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  24.84 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  26.32 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  23.87 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  24.88 
 
 		 480 aa  76.6  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  24.59 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 439 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.93 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  23.79 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  26.08 
 
 		 543 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  21.65 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  22.46 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  23.01 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  25.76 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 576 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  23.5 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 544 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 503 aa  73.6  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 530 aa  73.2  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.94 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 494 aa  73.2  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  21.98 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  22.93 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  21.98 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  27.66 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  22.87 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  24.69 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  24.69 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>