10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0043 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0043  paREP9  100 
 
 
127 aa  246  6e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00594954  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1944  paREP9  97.64 
 
 
127 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.899867  hitchhiker  0.000000000000153546 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0001  paREP9  97.52 
 
 
121 aa  230  5e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0560  paREP9  93.39 
 
 
121 aa  222  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.112364  hitchhiker  0.0000107885 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0575  paREP9  93.39 
 
 
121 aa  222  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.158938  normal  0.0596649 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1109  paREP9  92.56 
 
 
121 aa  221  4e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.566716  hitchhiker  0.000160386 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0961  paREP9  92.56 
 
 
121 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.935966  hitchhiker  0.000271589 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1540  paREP9  91.94 
 
 
124 aa  200  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.552044 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0281  hypothetical protein  53.72 
 
 
142 aa  111  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1143  hypothetical protein  64.52 
 
 
121 aa  83.6  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0299368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>