24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0028 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0944  hypothetical protein  80.61 
 
 		 472 aa  697    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000501517 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0028  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  942    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1070  hypothetical protein  73.65 
 
 		 475 aa  655    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0650  hypothetical protein  70.42 
 
 		 467 aa  616  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1168  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 516 aa  227  3e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.731614  normal  0.0353149 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1007  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 		 485 aa  225  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.256846  decreased coverage  0.000168852 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0248  extracellular solute-binding protein  35.03 
 
 		 511 aa  225  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.370696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0075  extracellular solute-binding protein  33.66 
 
 		 498 aa  219  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.735503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1808  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52130  periplasmic binding protein  30.89 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3241  phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC, putative  25.75 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.560629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2751  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  24.73 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4801  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2683  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  24.36 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  0.30829 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1990  putative regulatory lipoprotein  28.99 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 470 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0644  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  25.28 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.788627  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 378 aa  50.1  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2968  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.812096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2651  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  22.62 
 
 		 407 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0959912  hitchhiker  0.000467532 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2587  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  22.62 
 
 		 436 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>