107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0010 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  100 
 
 
323 aa  664    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  97.83 
 
 
323 aa  590  1e-167  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  91.79 
 
 
330 aa  580  1e-164  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  84.66 
 
 
340 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  52.45 
 
 
325 aa  317  3e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.16 
 
 
356 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.81 
 
 
388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  29.53 
 
 
358 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  31.65 
 
 
360 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  27.38 
 
 
351 aa  126  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  29.86 
 
 
353 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  29.12 
 
 
370 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  33.49 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  27 
 
 
376 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  26.96 
 
 
370 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  29.92 
 
 
387 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  25.65 
 
 
433 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  29.96 
 
 
360 aa  95.9  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  25.42 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  29.03 
 
 
376 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  29.89 
 
 
315 aa  92.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  24.49 
 
 
380 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  26.86 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  27.62 
 
 
355 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  26.45 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  26.2 
 
 
385 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  32.34 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  32.34 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  26.86 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  32.34 
 
 
346 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  29.11 
 
 
369 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  29.11 
 
 
369 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  29.03 
 
 
346 aa  89.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1399  hypothetical protein  26.98 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313372  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  30.39 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  32.34 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  28.64 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  32.34 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  29.72 
 
 
363 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  30 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  30 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  28.92 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  29.13 
 
 
343 aa  85.9  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  26.64 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  28.86 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2765  band 7 protein  25.12 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  26.76 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  27.23 
 
 
396 aa  79.3  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0822  band 7 protein  24.41 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  25.84 
 
 
369 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  29.9 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  27.27 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  26.15 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  32.26 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  20.73 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  53.19 
 
 
1151 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  51.06 
 
 
1151 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  20.29 
 
 
334 aa  62.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  48.94 
 
 
1149 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  28.05 
 
 
380 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  48.94 
 
 
1148 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0435  hypothetical protein  52.86 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  46.81 
 
 
1291 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  44.68 
 
 
1139 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  46.81 
 
 
1141 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  46.94 
 
 
680 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0586  hypothetical protein  53.06 
 
 
299 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0026  putative protein serine/threonine phosphatase  45.83 
 
 
651 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4022  protein serine/threonine phosphatase  40.82 
 
 
642 aa  52.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  46.51 
 
 
1138 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2434  FHA domain-containing protein  40.58 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0872027  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3047  FHA domain-containing protein  40.58 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0448  zinc finger, RanBP2-type  46 
 
 
259 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  39.62 
 
 
1123 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0619  putative protein serine/threonine phosphatase  44.68 
 
 
733 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163625  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0509  hypothetical protein  40.35 
 
 
237 aa  49.3  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000846135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1141  hypothetical protein  21.19 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  48.94 
 
 
131 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  40.43 
 
 
1105 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5969  hypothetical protein  43.86 
 
 
100 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1752  hypothetical protein  43.86 
 
 
100 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.298967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  33.85 
 
 
514 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2278  putative protein serine/threonine phosphatase  39.58 
 
 
669 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0271  FHA domain containing protein  33.78 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.373949 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2329  putative protein serine/threonine phosphatase  39.58 
 
 
669 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.580462  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  23.33 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  39.62 
 
 
1503 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  34.04 
 
 
1093 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1103  hypothetical protein  39.13 
 
 
408 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2031  zinc finger RanBP2-type  41.51 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3475  hypothetical protein  46.81 
 
 
101 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1720  hypothetical protein  37.93 
 
 
91 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.385485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2708  FHA domain containing protein  43.14 
 
 
263 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.042803  hitchhiker  0.0000000030829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1477  hypothetical protein  35 
 
 
155 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  32.81 
 
 
505 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4395  hypothetical protein  37.74 
 
 
93 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2306  hypothetical protein  38.89 
 
 
360 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  38.3 
 
 
1153 aa  42.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2272  hypothetical protein  38.89 
 
 
360 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.143558  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0534  FHA domain-containing protein  41.18 
 
 
272 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.895952  normal  0.110331 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>