133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0004 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0004  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
300 aa  611  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  82 
 
 
300 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.018451 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2016  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.78 
 
 
306 aa  413  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000701523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.88 
 
 
306 aa  394  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.64326  normal  0.538375 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
315 aa  146  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.744815  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
313 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  27.24 
 
 
320 aa  63.2  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.224338  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  24.89 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  25.75 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 
429 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.34 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  26.25 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 
317 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 
316 aa  55.8  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00302715  hitchhiker  0.000000109049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  25.75 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  29.12 
 
 
324 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.608202  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131768  normal  0.0846691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 
306 aa  53.1  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1420  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.56 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3340  NADH dehydrogenase  27.44 
 
 
334 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3663  NADH dehydrogenase  27.08 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.67 
 
 
336 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  35.48 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
308 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.59 
 
 
357 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 
307 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
316 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 
328 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
411 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0220  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.18 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
431 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  26.29 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000061436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1487  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.54 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000030027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
320 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
318 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.76 
 
 
321 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  26.98 
 
 
317 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  32.28 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1285  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.24 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2240  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.87 
 
 
381 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167528  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  28.28 
 
 
294 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
294 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26150  predicted protein  24.91 
 
 
366 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.33 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.32 
 
 
328 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.85 
 
 
366 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.34 
 
 
321 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
424 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  28.04 
 
 
318 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.34 
 
 
321 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  31.34 
 
 
321 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.34 
 
 
321 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.34 
 
 
321 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.34 
 
 
321 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.34 
 
 
321 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  28.8 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  27.81 
 
 
619 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.69 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  26.55 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  26.09 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.06 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  30.3 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.67 
 
 
389 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.72 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.31 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.440205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.88 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>