299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_R0094 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  98.72 
 
 
85 bp  147  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  95.29 
 
 
85 bp  137  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  92.54 
 
 
85 bp  93.7  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  92.54 
 
 
85 bp  93.7  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  87.8 
 
 
82 bp  83.8  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  87.8 
 
 
82 bp  83.8  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  87.8 
 
 
82 bp  83.8  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  87.8 
 
 
82 bp  83.8  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  87.8 
 
 
82 bp  83.8  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  90.48 
 
 
82 bp  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  75.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  87.84 
 
 
85 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  95.56 
 
 
87 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  95.56 
 
 
84 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  95.56 
 
 
84 bp  73.8  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  95.56 
 
 
87 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  89.23 
 
 
82 bp  73.8  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  95.56 
 
 
82 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  95.56 
 
 
84 bp  73.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0033  tRNA-Leu  90.16 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505134  normal  0.14321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0034  tRNA-Leu  90.16 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  normal  0.115675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0032  tRNA-Leu  90.16 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000103773  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0104  tRNA-Leu  90.16 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000390142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  97.5 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0128  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00106969  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0130  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584266  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0150  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0124  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141518  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  88.06 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0148  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0155  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0127  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000102689  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  69.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0133  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000286761  normal  0.279281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0152  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0093  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000286418  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0095  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588757  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0158  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0122  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0120  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00172985  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  85.9 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  85.9 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000146268  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  97.37 
 
 
82 bp  67.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  97.37 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  97.37 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  97.37 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  85.9 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  97.37 
 
 
82 bp  67.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  97.37 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  85.9 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0119  tRNA-Leu  88.52 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t015  tRNA-Leu  88.52 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  93.33 
 
 
82 bp  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0004  tRNA-Leu  87.69 
 
 
82 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0027  tRNA-Leu  88.52 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000000908106  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0128  tRNA-Leu  88.52 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0068  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000622539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  93.33 
 
 
82 bp  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t010  tRNA-Leu  88.52 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000827659  hitchhiker  0.00000000052642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0105  tRNA-Leu  88.52 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651737  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309087  tRNA-Leu  87.69 
 
 
82 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309138  tRNA-Leu  87.69 
 
 
82 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0111  tRNA-Leu  88.52 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000389505  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309179  tRNA-Leu  87.69 
 
 
82 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1765  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020879  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0039  tRNA-Leu  86.57 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00836126  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0038  tRNA-Leu  86.57 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00398477  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0037  tRNA-Leu  86.57 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21797  normal  0.0832006 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  87.3 
 
 
82 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  86.57 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  97.06 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  97.06 
 
 
81 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    97.06 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  97.06 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  97.06 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>