More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3713 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  77.3 
 
 
585 aa  896  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  77.3 
 
 
585 aa  896  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  67.78 
 
 
591 aa  798  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  68.2 
 
 
592 aa  786  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  77.12 
 
 
585 aa  890  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  76.95 
 
 
590 aa  887  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  70.47 
 
 
600 aa  825  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  76.95 
 
 
585 aa  893  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  72.1 
 
 
592 aa  805  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  100 
 
 
576 aa  1160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  74.22 
 
 
578 aa  847  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  77.12 
 
 
585 aa  904  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  77.3 
 
 
585 aa  896  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  1.94119e-07 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  77.3 
 
 
585 aa  894  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  77.3 
 
 
585 aa  896  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  57.91 
 
 
579 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  57.91 
 
 
579 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  57.58 
 
 
567 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  43.56 
 
 
578 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  44.15 
 
 
568 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  45.3 
 
 
569 aa  399  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  44.15 
 
 
568 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  43.95 
 
 
568 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  43.37 
 
 
573 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  35.1 
 
 
560 aa  309  8e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  33.39 
 
 
574 aa  295  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  35.65 
 
 
575 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  33.91 
 
 
565 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  36.3 
 
 
575 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  35.4 
 
 
590 aa  278  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  34.17 
 
 
573 aa  275  2e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  35.26 
 
 
580 aa  275  2e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  33.46 
 
 
595 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  32.89 
 
 
583 aa  268  3e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  34.75 
 
 
570 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  34.87 
 
 
570 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  34.94 
 
 
570 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  34.68 
 
 
582 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  33.53 
 
 
590 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  36.08 
 
 
587 aa  263  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  33.46 
 
 
576 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  33.83 
 
 
574 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  33.33 
 
 
592 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  33.46 
 
 
571 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  32.39 
 
 
579 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  33.95 
 
 
605 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  32.03 
 
 
586 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  34.86 
 
 
566 aa  250  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  34.17 
 
 
556 aa  249  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  32.82 
 
 
596 aa  249  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  33.33 
 
 
569 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  32.25 
 
 
569 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  32.25 
 
 
569 aa  247  5e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  31.23 
 
 
588 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.4 
 
 
610 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  33.7 
 
 
610 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.4 
 
 
610 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.7 
 
 
610 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.7 
 
 
610 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.7 
 
 
610 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  33.4 
 
 
610 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  34.42 
 
 
559 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  32.81 
 
 
572 aa  233  8e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  32.63 
 
 
576 aa  231  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  31.81 
 
 
567 aa  229  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  31.27 
 
 
584 aa  221  2e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  31.29 
 
 
563 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  32.31 
 
 
585 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  30.43 
 
 
574 aa  213  6e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  32.89 
 
 
573 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  31.07 
 
 
591 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  30.7 
 
 
588 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  29.62 
 
 
571 aa  210  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  31.46 
 
 
605 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  29.31 
 
 
570 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  28.68 
 
 
566 aa  206  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  31.06 
 
 
583 aa  206  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  29.49 
 
 
585 aa  206  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  31.54 
 
 
557 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  29.74 
 
 
578 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  28.51 
 
 
575 aa  202  1e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  30.52 
 
 
565 aa  202  2e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  29.93 
 
 
574 aa  201  4e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  32.95 
 
 
581 aa  197  4e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  30.93 
 
 
550 aa  197  5e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  31.14 
 
 
558 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  33.41 
 
 
730 aa  193  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  29.56 
 
 
570 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  28.62 
 
 
585 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2980  sulphate transporter  30.42 
 
 
558 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  27.34 
 
 
565 aa  190  6e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  28.92 
 
 
590 aa  190  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  30.07 
 
 
580 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.9535e-08  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4477  sulphate transporter  30 
 
 
624 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.496082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  31.45 
 
 
626 aa  188  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  29.45 
 
 
588 aa  187  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  29.81 
 
 
592 aa  186  1e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4576  sulphate transporter  30.35 
 
 
572 aa  186  1e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5729  sulphate transporter  30.35 
 
 
572 aa  186  1e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.46333 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3792  sulphate transporter  30.66 
 
 
619 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>