246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3614 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  100 
 
 		 300 aa  607  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  43.77 
 
 		 462 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  43.06 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  41.2 
 
 		 492 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  41.1 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  41.84 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  41.5 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  42.33 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.75 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  37.88 
 
 		 307 aa  224  9e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  39.02 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  39.25 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  38.61 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  38.64 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  39.47 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  38.85 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.85 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  38.85 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  38.85 
 
 		 304 aa  215  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  39.19 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  39.93 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  39.53 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4158  domain of unknown function DUF1731  38.72 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  38.38 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  43.09 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  38.78 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  38.62 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  39.73 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  40.54 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  38.38 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  39.38 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  39.73 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  37.88 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  39.38 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  39.26 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  38.8 
 
 		 320 aa  209  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  36.21 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  39.59 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6071  domain of unknown function DUF1731  38.1 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  38.23 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  39.59 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  39.6 
 
 		 453 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  40.61 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  38.23 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  39.25 
 
 		 295 aa  205  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  38.23 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  38.23 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  38.23 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  39.8 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  38.23 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  37.25 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  39.93 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  37.88 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.88 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  37.88 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  37.88 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  39.93 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  37.88 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  37.82 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.66 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  37.88 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.54 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  39.31 
 
 		 289 aa  201  9e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  36.24 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  37.7 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.84 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  38.31 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  37.05 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  38.67 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.92 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  38.83 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  36.21 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  36.75 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  35.59 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  35.91 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  37.67 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  37.54 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  37.67 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  36.61 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  38.57 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  36.61 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  36.61 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  40.74 
 
 		 452 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  38.91 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  40.74 
 
 		 452 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  40.74 
 
 		 452 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  39.02 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  37.05 
 
 		 313 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  35.96 
 
 		 456 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  37.25 
 
 		 298 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  39.29 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  37.46 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  40.4 
 
 		 449 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  38.46 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  37.8 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  35.05 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_002950  PG0996  hypothetical protein  35.91 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  36.7 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>