188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3586 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3586  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 		 447 aa  907    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  41 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  38.74 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  32.26 
 
 		 438 aa  189  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.34 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.72 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.09 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4660  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.71 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.92 
 
 		 453 aa  153  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0207  flagellar hook-associated protein 2  25.17 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.547733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.8 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  29.33 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.83 
 
 		 457 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.73 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.98 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  29.04 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.3 
 
 		 457 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.19 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.18 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  28.48 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0655  flagellar hook-associated protein 2  25.06 
 
 		 428 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  26.86 
 
 		 438 aa  143  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  27.06 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.35 
 
 		 456 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.61 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.61 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.85 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.77 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.74 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  26.5 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  24.68 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.45 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.86 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.26 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  26.88 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  25.63 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  25.63 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.63 
 
 		 487 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.77 
 
 		 470 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  24.2 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  26.28 
 
 		 500 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.76 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  26.21 
 
 		 474 aa  100  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.17 
 
 		 465 aa  99.8  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.59 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  26.23 
 
 		 441 aa  96.3  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  27.76 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.79 
 
 		 505 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  28.4 
 
 		 541 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  29.66 
 
 		 781 aa  94  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  26.53 
 
 		 541 aa  93.6  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  25.9 
 
 		 505 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.09 
 
 		 472 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.63 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  26.85 
 
 		 471 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  25.61 
 
 		 474 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  26.56 
 
 		 467 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  26.56 
 
 		 467 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  26.56 
 
 		 467 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  27.49 
 
 		 668 aa  89  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  26.15 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1554  flagellar capping protein  23.71 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1671  flagellar capping protein  23.71 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  26.09 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  26.54 
 
 		 465 aa  87  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1528  flagellar capping protein  22.48 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00317028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.77 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1517  flagellar capping protein  22.77 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  25.06 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  25.56 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.94 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0114  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.07 
 
 		 852 aa  85.1  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  26.93 
 
 		 677 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.15 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  24.57 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.05 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  25.22 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  25.64 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1738  flagellar capping protein  22.2 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  25.64 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  25.64 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1353  flagellar capping protein  24.77 
 
 		 448 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  26.58 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  25.11 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  24.78 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  25.62 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.65 
 
 		 678 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.65 
 
 		 678 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  24.78 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  23.75 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.75 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.89 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0994  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.05 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.864471  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.76 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.44 
 
 		 657 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.06 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  24.2 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>