136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3585 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3585  flagellar protein FliS  100 
 
 
126 aa  255  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  37.61 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  37.61 
 
 
130 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  35.25 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3637  flagellar protein FliS  37.19 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  31.4 
 
 
126 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  30.65 
 
 
132 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  34.71 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  32.23 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  33.88 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  33.06 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
136 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  32.17 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  35.65 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  27.73 
 
 
133 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0177  flagellar protein FliS  28.45 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.711098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0229  flagellar protein FliS  28.45 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  26.89 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  26.05 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  26.05 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  26.5 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  26.5 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  25.21 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  25.21 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  26.5 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  25.21 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  25.21 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  24.79 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0656  flagellar protein FliS  28.8 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  26.5 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  27.83 
 
 
129 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  26.5 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  29.66 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0206  flagellar protein FliS  28.8 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  29.06 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  24.8 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50250  flagellar protein FliS  27.12 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194402  decreased coverage  0.0000900366 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  24.37 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  27.87 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  27.2 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  29 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  24.17 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.23 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3567  flagellar protein FliS  27.97 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.530482  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  28.81 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  25.42 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  27.43 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  29.03 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  24.35 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  22.88 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  26.32 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0634  flagellar protein FliS  28.21 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  27.64 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0212  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  27.42 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.523673  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  26.09 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  26.09 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  26.09 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  25.21 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  25.21 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  25.21 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  21.74 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  25.21 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  25.21 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  25.44 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3463  flagellar protein FliS  25.83 
 
 
129 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.220279  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  26.09 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  25.41 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0202  flagellar protein FliS  24.58 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3936  flagellar protein FliS  26.19 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  25.83 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  26.8 
 
 
275 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  25.66 
 
 
286 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  23.97 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  27.05 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  23.73 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  23.73 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  25.44 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2921  flagellar protein FliS  27.68 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  26.72 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  23.73 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  23.73 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  23.73 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  23.73 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  23.73 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  24.35 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  26.5 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  22.02 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  22.02 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  23.48 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>