98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3558 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3558  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 234 aa  474  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  25.21 
 
 		 265 aa  95.1  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.98 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3652  flageller protein FlgA  28.25 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.64 
 
 		 272 aa  85.1  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.14 
 
 		 282 aa  85.1  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.14 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  26.29 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.11 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  22.54 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.59 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2965  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.59 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.639269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.59 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.14 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.95 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3469  SAF domain-containing protein  26.05 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2950  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.99 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.892014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1473  putative flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  28.24 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.06 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2600  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.52 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3244  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.27 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.23 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3972  SAF domain-containing protein  26.29 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.21 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.47 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  23.98 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1318  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.04 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.56 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.47 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1795  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.77 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  26.24 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.36 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  28.47 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1326  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.44 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.67 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1256  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.44 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3270  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  35.2 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0824  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.67 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  25.41 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3046  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.4 
 
 		 348 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.18 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.78 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.56 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.85 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0741  flagellar protein FLGA precursor  28.57 
 
 		 159 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.21 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  22.67 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.01 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.67 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.85 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0259  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.52 
 
 		 169 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.87 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.33 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  29.33 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.1 
 
 		 366 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1524  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.45 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.97 
 
 		 160 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1430  flagellar basal body P-ring formation protein FlgA  29.31 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.04 
 
 		 358 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1505  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.47 
 
 		 370 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1158  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.32 
 
 		 235 aa  52  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.623618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.15 
 
 		 355 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4424  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.1 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1140  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.85 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  22.18 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0353  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.68 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0779084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.22 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 380 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.22 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2560  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.89 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.72 
 
 		 360 aa  49.7  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0294  flagellar protein FlgA  33.73 
 
 		 157 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3677  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.42 
 
 		 176 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  22.67 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1382  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.63 
 
 		 373 aa  49.3  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.58 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1621  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  28.07 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.99379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1979  flageller protein FlgA  24.71 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4208  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.49 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.2 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0622  FlgA, flagellar basal-body P-ring formation protein  25 
 
 		 164 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0633  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25 
 
 		 164 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683972  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3652  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  30.59 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.265024  normal  0.613737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0028  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.34 
 
 		 148 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1655  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  36.07 
 
 		 170 aa  45.4  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0600  FlgA, flagellar basal-body P-ring formation protein  23.86 
 
 		 162 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5624  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  21.84 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1667  SAF domain-containing protein  26.32 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0285706  normal  0.0223533 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1477  flageller protein FlgA  23.88 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0139  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.63 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.126341  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.63 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  27.78 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.43 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.292219  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0036  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  26.32 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.36 
 
 		 326 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2925  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  22.6 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2519  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.31 
 
 		 346 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.78 
 
 		 243 aa  41.6  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>