286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3549 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 315 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  48.23 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  46.65 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  46.45 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  46.77 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  45.83 
 
 		 318 aa  262  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  45.36 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  43.3 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  43.37 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  41.21 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  43.17 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  40.78 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  40.91 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  42.37 
 
 		 549 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  40.48 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  39.17 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  41.9 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  38.22 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  40 
 
 		 317 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01082  putative carboxylase  36.84 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351905  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  37.18 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  36.89 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37310  hypothetical protein  42.16 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000804983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3201  hypothetical protein  41.79 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1031  allophanate hydrolase subunit 2  39.8 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  37.22 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  38.61 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  36.27 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.25 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.25 
 
 		 359 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.25 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.25 
 
 		 359 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.25 
 
 		 359 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.25 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.25 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  36.62 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  36.98 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  36.98 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  36.98 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  35.62 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  34.11 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  34.85 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.66 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  36.66 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  37.25 
 
 		 356 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  37.13 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  35.69 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  37.25 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  36.02 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.33 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  37.29 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  32.68 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  37.54 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  34.64 
 
 		 353 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  37.21 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  37.29 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  32.15 
 
 		 329 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  36.88 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  33.12 
 
 		 348 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  36.96 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  36.3 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  36.96 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  36.96 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.96 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  36.96 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  36.3 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.3 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  36.3 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  33.44 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  36.96 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  35.9 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  36.3 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  35.53 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  35.16 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  34.7 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  36 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  36.39 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  32.92 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  33.66 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  35.6 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  32.79 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  36.73 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  32.8 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  32.8 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  30.23 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  31.63 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  34.56 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  34.1 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  29.71 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  30.6 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  30.6 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  35.48 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  30.23 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  30.6 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  29.9 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  36.49 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  33.12 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  29.07 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  33.66 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  31.31 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>