225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3547 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3547  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 243 aa  507  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  53.31 
 
 		 246 aa  275  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05795  LamB/YcsF family protein  51.87 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  50.83 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  50.83 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  50.83 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000162  lactam utilization protein LAMB  52.7 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.078695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  51.05 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  50.21 
 
 		 242 aa  254  6e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  50.41 
 
 		 258 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 259 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  49.17 
 
 		 250 aa  251  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  48.75 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  50.64 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0361  LamB/YcsF family protein  49.37 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.135278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1436  LamB/YcsF family protein  48.96 
 
 		 246 aa  244  8e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1497  LamB/YcsF family protein  49.79 
 
 		 246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.910801  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  48.76 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1983  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 		 241 aa  238  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3199  LamB/YcsF family protein  48.76 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  48.76 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1736  LamB/YcsF family protein  45 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  44.63 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  48.05 
 
 		 257 aa  221  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  43.39 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  43.57 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  42.5 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  45.04 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  38.59 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  45.61 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  42.15 
 
 		 258 aa  208  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  43.1 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  39 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  40.17 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  39.42 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  43.57 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  43.39 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  42.98 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  44.21 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  38.17 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  38.59 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  43.86 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01080  LamB/YcsF family protein  43.8 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  38.17 
 
 		 253 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  38.17 
 
 		 253 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  38.49 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  42.39 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  37.76 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  38.59 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  44.21 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  44.81 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  38.43 
 
 		 250 aa  198  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  41.94 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  41.1 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  41.35 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  42.56 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  38.43 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  41.25 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  43.04 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  43.1 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  38.49 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  40.5 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  41.38 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  41.08 
 
 		 301 aa  187  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  42.56 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  40.08 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  41.56 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  42.08 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  38.33 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  40.33 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0545  LamB/YcsF family protein  43.04 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000543397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  37.6 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  41.99 
 
 		 273 aa  185  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  38.72 
 
 		 255 aa  184  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  38.72 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  42.67 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  42.24 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0010  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  39.39 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  40.5 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  39.39 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  39.39 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  41.99 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  38.1 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  41.81 
 
 		 255 aa  181  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  40.66 
 
 		 251 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  38.3 
 
 		 255 aa  181  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  40.5 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  39.33 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  39.33 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  38.43 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  39.67 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  41.92 
 
 		 254 aa  179  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  40.5 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>