More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3457 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 508 aa  1046    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.99 
 
 		 506 aa  566  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.41 
 
 		 315 aa  347  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.94 
 
 		 322 aa  345  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.68 
 
 		 321 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  53.5 
 
 		 318 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.95 
 
 		 319 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.44 
 
 		 320 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  53.77 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.75 
 
 		 313 aa  332  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.8 
 
 		 320 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.31 
 
 		 320 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 319 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  51.43 
 
 		 321 aa  325  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.78 
 
 		 320 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  50.32 
 
 		 326 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.77 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.84 
 
 		 322 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.77 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.88 
 
 		 320 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 		 323 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.84 
 
 		 315 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  51.59 
 
 		 326 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  50 
 
 		 323 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.15 
 
 		 313 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  48.08 
 
 		 309 aa  297  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.59 
 
 		 293 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 		 309 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3173  UDP-galactose 4-epimerase, putative  50.16 
 
 		 309 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0590  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  71.35 
 
 		 188 aa  279  7e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.13 
 
 		 309 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  46.43 
 
 		 306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3387  sugar transferase  67.4 
 
 		 182 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3032  galactosyl transferase, capsular polysaccharide synthesis enzyme  75.69 
 
 		 182 aa  273  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3271  sugar transferase  66.85 
 
 		 182 aa  272  9e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0812  sugar transferase  69.61 
 
 		 185 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.201129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.31 
 
 		 302 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.448502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.4 
 
 		 321 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 		 328 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2528  sugar transferase  75.15 
 
 		 184 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3172  galactosyl transferase  76.1 
 
 		 185 aa  256  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.43 
 
 		 338 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1485  sugar transferase  74.21 
 
 		 182 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00302801  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2640  putative capsule biosynthesis protein  70.72 
 
 		 184 aa  250  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.21 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1277  sugar transferase  63.33 
 
 		 183 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.5 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2877  sugar transferase  73.86 
 
 		 184 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.32 
 
 		 320 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.63 
 
 		 318 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1539  sugar transferase  59.67 
 
 		 183 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0350538  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1843  galactosyl-transferase, putative  61.29 
 
 		 191 aa  229  9e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.82 
 
 		 320 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  39.74 
 
 		 324 aa  224  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.76 
 
 		 323 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  39.05 
 
 		 320 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  39.87 
 
 		 318 aa  220  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2612  sugar transferase  68.21 
 
 		 186 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00297652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.31 
 
 		 321 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 		 321 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.68 
 
 		 307 aa  216  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.99 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.88 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.99 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  38.68 
 
 		 318 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  37.94 
 
 		 318 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.83 
 
 		 321 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.83 
 
 		 321 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.83 
 
 		 321 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.83 
 
 		 321 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.83 
 
 		 321 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.83 
 
 		 321 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  36.51 
 
 		 321 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  36.83 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 		 307 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 		 307 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0778  sugar transferase  48.24 
 
 		 189 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 		 307 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 		 285 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0745  sugar transferase  42.86 
 
 		 451 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  30.54 
 
 		 307 aa  156  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 		 321 aa  148  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.99 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4101  sugar transferase  41.53 
 
 		 211 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0756237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 		 287 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  30.95 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5069  sugar transferase  41.21 
 
 		 210 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 		 311 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  31.21 
 
 		 290 aa  133  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 310 aa  131  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 305 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  49.64 
 
 		 185 aa  127  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  49.64 
 
 		 185 aa  127  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  39.88 
 
 		 186 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 349 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1626  sugar transferase  44.3 
 
 		 186 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2615  sugar transferase  40.76 
 
 		 188 aa  123  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3507  sugar transferase  43.45 
 
 		 211 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6496  sugar transferase  45.77 
 
 		 188 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.72 
 
 		 196 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>