27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3433 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3433  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  423  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0773  hypothetical protein  30.08 
 
 		 254 aa  94.7  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0548647  unclonable  0.0000000000796342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4196  hypothetical protein  31.08 
 
 		 249 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000215538  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  27.94 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000019199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0543  hypothetical protein  27.95 
 
 		 252 aa  85.9  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718066  normal  0.604176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3226  hypothetical protein  28.23 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000725415  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  31.08 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0812  hypothetical protein  27.31 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000586351  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0780  hypothetical protein  27.31 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000762567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3579  hypothetical protein  27.31 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000110891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  32.22 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3905  hypothetical protein  28.72 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0805  hypothetical protein  27.52 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000415651  hitchhiker  0.000000000063684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3333  hypothetical protein  26.83 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0150205  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  27.6 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0400  hypothetical protein  29.38 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.458276  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0752  hypothetical protein  29.1 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000104845  normal  0.017498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0724  hypothetical protein  29.1 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000015789  hitchhiker  0.00185842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3237  hypothetical protein  29.1 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000795933  hitchhiker  0.0000110881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0767  hypothetical protein  29.1 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000836076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3049  hypothetical protein  27.42 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00345897  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2792  hypothetical protein  27.01 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00007  hypothetical protein  30.92 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002348  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system component  25.37 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  23.81 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2088  hypothetical protein  24.44 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3608  hypothetical protein  31.61 
 
 		 199 aa  42  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290926  normal  0.0278483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>