More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3225 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  100 
 
 		 443 aa  905    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  44.88 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  46.4 
 
 		 423 aa  309  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  43.53 
 
 		 431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  41.35 
 
 		 434 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  41.6 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  41.6 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  44.86 
 
 		 431 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  45.09 
 
 		 418 aa  300  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  47.42 
 
 		 419 aa  299  7e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  45.75 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  45.75 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  45.75 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  45.75 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  46.08 
 
 		 428 aa  292  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  42.74 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  44.28 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  41.49 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  43.33 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  37.95 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  45.29 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  37.68 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  37.68 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  40.98 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  36.6 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  37.79 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  37.79 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  37.79 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  37.79 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  37.79 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  37.79 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  37.79 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  37.79 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  35.58 
 
 		 441 aa  275  8e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  41.14 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  39.3 
 
 		 439 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  39.3 
 
 		 439 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  39.3 
 
 		 439 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  39.3 
 
 		 439 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  39.3 
 
 		 439 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  36.58 
 
 		 439 aa  273  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  36.21 
 
 		 440 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  40.53 
 
 		 419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  37.84 
 
 		 470 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  37.64 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  36.41 
 
 		 482 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  39.39 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  33.26 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  33.26 
 
 		 466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  33.03 
 
 		 466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  32.08 
 
 		 482 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  36.94 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  31.51 
 
 		 468 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  36.95 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  31.28 
 
 		 468 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  31.28 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  31.05 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  35.82 
 
 		 429 aa  225  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  31.05 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  38.31 
 
 		 550 aa  219  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  34.68 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  30.98 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  31.38 
 
 		 472 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  33.71 
 
 		 470 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  33.24 
 
 		 512 aa  210  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  29.41 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  35.22 
 
 		 475 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  34.23 
 
 		 491 aa  206  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  30.95 
 
 		 439 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  36.63 
 
 		 498 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  34.08 
 
 		 475 aa  199  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30.8 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  34.3 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  32.52 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  33.53 
 
 		 468 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  30.38 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  31.61 
 
 		 503 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  31.32 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  32.19 
 
 		 474 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  29.62 
 
 		 477 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  31.82 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  31.38 
 
 		 473 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  32.46 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  31.16 
 
 		 475 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  31.29 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  32.46 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  32 
 
 		 472 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  29.98 
 
 		 490 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  31.38 
 
 		 479 aa  169  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  32.41 
 
 		 438 aa  169  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  30.61 
 
 		 470 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  32.86 
 
 		 503 aa  166  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.54 
 
 		 480 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  29.94 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  33.23 
 
 		 430 aa  162  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  38.55 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  29.79 
 
 		 472 aa  153  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  30.14 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.86 
 
 		 441 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  28.82 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>