28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2981 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  35.37 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  37.6 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  31.61 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  32.74 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0385  hypothetical protein  33.59 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  35.58 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  28.7 
 
 
314 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1949  hypothetical protein  32.8 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129845  normal  0.699527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  27.35 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  28.35 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  30.95 
 
 
188 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  25.64 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  27.12 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  26.5 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  27.35 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  26.74 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  31.46 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  27.12 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  23.48 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  22.31 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  22.88 
 
 
160 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  27.05 
 
 
272 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  27.27 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  28.57 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  31.11 
 
 
188 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  24.11 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  23.85 
 
 
166 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>