76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2910 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  69.47 
 
 		 450 aa  659    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  100 
 
 		 452 aa  914    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  66.67 
 
 		 451 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  67.48 
 
 		 449 aa  646    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  66.59 
 
 		 450 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  66.59 
 
 		 450 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  68.45 
 
 		 453 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  64.9 
 
 		 452 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  68.14 
 
 		 452 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  67.98 
 
 		 453 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  64.16 
 
 		 544 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  64.1 
 
 		 452 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  63.21 
 
 		 449 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  42.82 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  41.87 
 
 		 432 aa  318  9e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  38.1 
 
 		 424 aa  286  7e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  39.04 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  35.33 
 
 		 448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 457 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  36.75 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  36.41 
 
 		 462 aa  252  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  38.05 
 
 		 440 aa  249  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  36.03 
 
 		 482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  36.92 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  35.7 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  34.38 
 
 		 498 aa  232  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.58 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  34.25 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  35.82 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  33.95 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  33.09 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  32 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  32.91 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  31.91 
 
 		 442 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  31.5 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  28.84 
 
 		 447 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 447 aa  143  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 434 aa  53.9  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5274  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1317  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23 
 
 		 435 aa  47.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0849  extracellular solute-binding protein  20.54 
 
 		 434 aa  47  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0177782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2738  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.345118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 451 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 435 aa  43.5  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.99 
 
 		 442 aa  43.1  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>