More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2852 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  57.91 
 
 
582 aa  669  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  100 
 
 
559 aa  1136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  60.24 
 
 
584 aa  701  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  57.17 
 
 
581 aa  655  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  58.55 
 
 
582 aa  664  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  56.97 
 
 
582 aa  647  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  56.65 
 
 
581 aa  669  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  71.33 
 
 
560 aa  820  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  54.51 
 
 
591 aa  627  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.36 
 
 
592 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.85 
 
 
561 aa  618  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.98 
 
 
558 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  50.9 
 
 
568 aa  591  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  50.09 
 
 
559 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  49.02 
 
 
559 aa  519  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.56 
 
 
561 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  41.59 
 
 
543 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  41.23 
 
 
544 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  41.59 
 
 
544 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  41.59 
 
 
556 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  41.59 
 
 
543 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  39.56 
 
 
561 aa  416  1e-115  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.98772e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  38.99 
 
 
563 aa  412  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  37.57 
 
 
561 aa  407  1e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  42.28 
 
 
560 aa  399  1e-110  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  37.93 
 
 
560 aa  399  1e-110  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  37.93 
 
 
560 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  40.33 
 
 
546 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  37.34 
 
 
558 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  35.82 
 
 
565 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.86884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.66 
 
 
559 aa  369  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.94 
 
 
559 aa  364  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  37.85 
 
 
586 aa  356  6e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  33.88 
 
 
564 aa  345  1e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.93 
 
 
501 aa  340  3e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  35.64 
 
 
557 aa  338  1e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  35.49 
 
 
551 aa  336  6e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  35.62 
 
 
558 aa  336  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.74003e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.55 
 
 
559 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.1 
 
 
554 aa  335  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.41 
 
 
558 aa  334  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
558 aa  333  7e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  34.83 
 
 
557 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  34.7 
 
 
558 aa  322  1e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  33.39 
 
 
599 aa  313  4e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.47 
 
 
501 aa  310  3e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  34.77 
 
 
552 aa  308  1e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  33.33 
 
 
556 aa  308  1e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  33.7 
 
 
547 aa  306  5e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  36.88 
 
 
556 aa  290  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  32.91 
 
 
562 aa  289  9e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.95 
 
 
555 aa  287  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  31.19 
 
 
565 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  36.23 
 
 
550 aa  285  2e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  32.49 
 
 
565 aa  283  7e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  32.49 
 
 
565 aa  283  7e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.74 
 
 
558 aa  281  3e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  32.33 
 
 
571 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.96 
 
 
547 aa  280  4e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  31.57 
 
 
555 aa  280  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  37.56 
 
 
544 aa  280  6e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  33.78 
 
 
557 aa  279  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.04 
 
 
549 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  33.14 
 
 
552 aa  275  2e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  33.01 
 
 
560 aa  269  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  29.89 
 
 
537 aa  267  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.52 
 
 
557 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  30.73 
 
 
606 aa  264  4e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  29.89 
 
 
537 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.43 
 
 
559 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  31.32 
 
 
557 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.52 
 
 
506 aa  260  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.93 
 
 
557 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  32.23 
 
 
558 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  33.12 
 
 
582 aa  256  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  9.24249e-08  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  31.09 
 
 
549 aa  256  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5398  hypothetical protein  40.18 
 
 
538 aa  256  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61189  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.98 
 
 
563 aa  255  2e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.76 
 
 
509 aa  254  2e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  32.56 
 
 
652 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  30.45 
 
 
549 aa  254  4e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.18 
 
 
573 aa  253  5e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  31.01 
 
 
549 aa  253  5e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  31.2 
 
 
547 aa  253  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  33.48 
 
 
578 aa  253  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.25 
 
 
561 aa  253  9e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  31.3 
 
 
545 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.48 
 
 
533 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  30.81 
 
 
549 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.27 
 
 
533 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  30.17 
 
 
547 aa  249  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.68 
 
 
525 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.04 
 
 
530 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.68 
 
 
525 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.68 
 
 
525 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  32.11 
 
 
571 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  29.26 
 
 
549 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.88 
 
 
504 aa  248  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.15 
 
 
553 aa  247  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  31.58 
 
 
549 aa  246  6e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>