104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2846 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  67.54 
 
 
899 aa  1206    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  100 
 
 
889 aa  1837    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  38.39 
 
 
656 aa  232  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
697 aa  229  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
1406 aa  225  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.86 
 
 
1764 aa  223  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  30.38 
 
 
700 aa  220  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  30.82 
 
 
725 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 
709 aa  203  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  31.92 
 
 
652 aa  202  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  27.07 
 
 
669 aa  200  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  33.43 
 
 
663 aa  197  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  33.77 
 
 
695 aa  195  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  30.06 
 
 
578 aa  191  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
573 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  27.86 
 
 
542 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  31.12 
 
 
677 aa  184  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  31.66 
 
 
634 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  33.54 
 
 
648 aa  178  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  27.38 
 
 
637 aa  176  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  32.63 
 
 
532 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  28.86 
 
 
673 aa  174  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  32.03 
 
 
720 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  28.41 
 
 
530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 
530 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  30.39 
 
 
536 aa  164  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  31.83 
 
 
525 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  31.03 
 
 
717 aa  161  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
713 aa  155  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  30.06 
 
 
762 aa  154  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.06 
 
 
762 aa  154  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  32.8 
 
 
322 aa  153  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  34.7 
 
 
604 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  29.95 
 
 
488 aa  150  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  34.15 
 
 
624 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  28.98 
 
 
527 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  30.81 
 
 
531 aa  145  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.29 
 
 
549 aa  145  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  29.11 
 
 
524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  30.34 
 
 
742 aa  142  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  27.34 
 
 
548 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  31.93 
 
 
542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  27.22 
 
 
546 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  29.08 
 
 
670 aa  130  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  27.08 
 
 
533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  28.98 
 
 
519 aa  122  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.22 
 
 
636 aa  114  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  27.69 
 
 
625 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  23.4 
 
 
594 aa  112  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  29.34 
 
 
484 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
685 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  28.81 
 
 
529 aa  100  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  23.32 
 
 
614 aa  97.8  9e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
538 aa  95.1  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  24.52 
 
 
514 aa  95.1  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1937  hypothetical protein  30.5 
 
 
394 aa  89.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314612  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
502 aa  89  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
494 aa  87  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  27.83 
 
 
626 aa  86.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  25.1 
 
 
482 aa  86.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  26.09 
 
 
307 aa  79.7  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  19.87 
 
 
510 aa  73.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  22.89 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  23.47 
 
 
281 aa  61.6  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  22.76 
 
 
266 aa  60.1  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  20.25 
 
 
362 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  26.79 
 
 
290 aa  57.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 
505 aa  57.4  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
1037 aa  56.2  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  26.41 
 
 
3045 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22840  sulfotransferase  23.55 
 
 
328 aa  52  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2328  sulfotransferase  23.75 
 
 
335 aa  51.6  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195926  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2481  hypothetical protein  23.93 
 
 
269 aa  51.6  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  25.45 
 
 
370 aa  51.2  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2328  sulfotransferase  24.11 
 
 
309 aa  50.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3552  sulfotransferase  25.35 
 
 
320 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0188645 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1697  CurM  21.2 
 
 
358 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  23.48 
 
 
341 aa  49.7  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2675  sulfotransferase  22.61 
 
 
344 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.383164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  32.11 
 
 
729 aa  48.5  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
808 aa  48.9  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  18.9 
 
 
832 aa  48.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
884 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0322  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
401 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000024467  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1177  sulfotransferase  23.46 
 
 
325 aa  47.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3924  sulfotransferase  24.09 
 
 
314 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0563915  normal  0.391317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3104  sulfotransferase  29.19 
 
 
368 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
598 aa  47  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  23.6 
 
 
864 aa  46.2  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  20.73 
 
 
992 aa  45.8  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 
4489 aa  45.8  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0295  sulfotransferase  22.37 
 
 
280 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  22.71 
 
 
1415 aa  45.8  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  34.78 
 
 
474 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0295  sulfotransferase  22.57 
 
 
280 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
4079 aa  45.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4096  sulfotransferase  24 
 
 
282 aa  45.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.35 
 
 
810 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.97 
 
 
742 aa  44.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>