36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2718 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2718  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  246  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1415  hypothetical protein  63.03 
 
 		 120 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.130351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2265  hypothetical protein  52.94 
 
 		 119 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2142  hypothetical protein  48.76 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2142  hypothetical protein  50.43 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000300583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2314  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2030  hypothetical protein  47.46 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000942918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2676  hypothetical protein  46.15 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208691  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1754  hypothetical protein  47.01 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.00155716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2592  hypothetical protein  47.01 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000971711  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1991  hypothetical protein  51.43 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2460  hypothetical protein  51.43 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000033516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2706  hypothetical protein  46.15 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000140382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2631  hypothetical protein  46.15 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000548567  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2342  hypothetical protein  51.43 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2270  hypothetical protein  51.43 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2317  hypothetical protein  49.52 
 
 		 119 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000394227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1903  hypothetical protein  43.59 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000176347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1946  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000181986  normal  0.0225511 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1711  hypothetical protein  38.05 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003401  hypothetical protein  38.24 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000284049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02381  hypothetical protein  33.61 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0867  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  31.73 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.223142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0987  hypothetical protein  32.69 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.411283  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  31.33 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  33.73 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2974  hypothetical protein  27.88 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1422  hypothetical protein  27.66 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  33.73 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  28.85 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  27.71 
 
 		 127 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3246  hypothetical protein  32.84 
 
 		 135 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>