23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2685 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  527  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1095  NERD domain-containing protein  51.2 
 
 		 254 aa  255  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00991797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  33.86 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  31.64 
 
 		 321 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  30.31 
 
 		 304 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3140  hypothetical protein  29.72 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  30.49 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  30.49 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  30.49 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  30.49 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  28.85 
 
 		 310 aa  99  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  28.02 
 
 		 308 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0264  hypothetical protein  24.7 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.8207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  32.75 
 
 		 540 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  27.08 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2823  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00350669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  41.82 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  24.85 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  22.94 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  25.14 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  39.29 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  39.29 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  36.76 
 
 		 211 aa  42  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>