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for query gene Ping_2618 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2618  major facilitator transporter  100 
 
 
484 aa  950    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.876226 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  61.54 
 
 
477 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0060  major facilitator transporter  53.33 
 
 
482 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0064  major facilitator transporter  53.33 
 
 
482 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000292111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0062  major facilitator transporter  53.12 
 
 
482 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0063  major facilitator superfamily MFS_1  53.96 
 
 
487 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0064  major facilitator transporter  53.75 
 
 
487 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31678  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0059  major facilitator transporter  53.96 
 
 
487 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4295  major facilitator transporter  53.96 
 
 
487 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.68 
 
 
483 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  33.26 
 
 
494 aa  259  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.68 
 
 
483 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.83 
 
 
483 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  35.1 
 
 
515 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  33.96 
 
 
501 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.87 
 
 
569 aa  253  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
483 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.13 
 
 
666 aa  252  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.82 
 
 
682 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.03 
 
 
676 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.82 
 
 
682 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.82 
 
 
682 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.64 
 
 
680 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 
528 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 
522 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 
554 aa  240  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.74 
 
 
504 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.27 
 
 
528 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.29 
 
 
530 aa  236  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.77 
 
 
593 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 
505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
555 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.6 
 
 
532 aa  234  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.16 
 
 
535 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.57 
 
 
650 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 
528 aa  232  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.32 
 
 
538 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 
685 aa  229  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.74 
 
 
498 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 
526 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 
571 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 
526 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 
567 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.11 
 
 
501 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.31 
 
 
697 aa  227  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3058  major facilitator superfamily permease  34.75 
 
 
527 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0549474  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.73 
 
 
504 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.87 
 
 
514 aa  226  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.31 
 
 
672 aa  226  8e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.3 
 
 
539 aa  226  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.21 
 
 
678 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.32 
 
 
504 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 
504 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
558 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.48 
 
 
509 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.48 
 
 
509 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 
525 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 
448 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.73 
 
 
509 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.16 
 
 
526 aa  223  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 
530 aa  222  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 
575 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.24 
 
 
685 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.56 
 
 
523 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  34.87 
 
 
513 aa  220  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.28 
 
 
607 aa  220  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 
504 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 
504 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 
504 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 
509 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 
504 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 
504 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 
504 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 
504 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.8 
 
 
504 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 
519 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  30.84 
 
 
1062 aa  217  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 
562 aa  217  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.97 
 
 
535 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.12 
 
 
592 aa  216  9e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 
524 aa  216  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
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NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 
534 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  31.42 
 
 
537 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 
516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.74 
 
 
513 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
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NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.06 
 
 
685 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
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NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.76 
 
 
522 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.92 
 
 
565 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 
621 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.88 
 
 
537 aa  213  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.04 
 
 
504 aa  213  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.3 
 
 
520 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
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NC_003296  RS05301  integral membrane transmembrane protein  33.1 
 
 
520 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.51 
 
 
523 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
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NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.8 
 
 
641 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.07 
 
 
526 aa  209  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.13 
 
 
557 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
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NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 
890 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal 
 
 
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NC_008541  Arth_3998  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.49 
 
 
550 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  33.59 
 
 
666 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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