More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2617 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2617  citrate synthase I  100 
 
 		 436 aa  913    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.819839 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  68.36 
 
 		 448 aa  632  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2042  citrate synthase I  67.9 
 
 		 447 aa  622  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  66.74 
 
 		 450 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  65.59 
 
 		 447 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  64.14 
 
 		 455 aa  604  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2083  citrate synthase  65.13 
 
 		 447 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  64.6 
 
 		 455 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0336  citrate synthase I  64.12 
 
 		 447 aa  595  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000388875  normal  0.187011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  62.59 
 
 		 443 aa  597  1e-169  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2417  citrate synthase I  63.97 
 
 		 447 aa  597  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2007  citrate synthase I  63.82 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3738  citrate synthase I  62.61 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.680995  normal  0.033422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3488  citrate synthase I  61.47 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  60.28 
 
 		 445 aa  559  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0581  citrate synthase I  62.39 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  59.03 
 
 		 447 aa  541  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1835  citrate synthase I  62.1 
 
 		 422 aa  535  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  50.11 
 
 		 434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  51.48 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  50.91 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  49.89 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  49.65 
 
 		 439 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  49.77 
 
 		 433 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  48.06 
 
 		 431 aa  458  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  49.77 
 
 		 434 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  51.53 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  50.82 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  50.47 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  50.35 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  49.09 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  49.77 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  50.35 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  49.77 
 
 		 438 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  49.77 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  48.86 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  48.28 
 
 		 434 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  49.3 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  49.19 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  49.08 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  49.77 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  50.47 
 
 		 431 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  49.88 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  49.18 
 
 		 427 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  52.03 
 
 		 427 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  52.69 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  49.18 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  48.5 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  48.96 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  49.3 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2146  type II citrate synthase  48.73 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  47.84 
 
 		 429 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  49.06 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1822  type II citrate synthase  48.73 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.724589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  49.65 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  51.23 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  48.5 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  46.88 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  49.53 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  50.73 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  49.41 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  50.64 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  52.05 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  52.31 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  53.98 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  49.18 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  54.24 
 
 		 429 aa  438  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  49.19 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  49.88 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  48.36 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  50.64 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  49.65 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  49.19 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  53.83 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  48.05 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  49.88 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  49.88 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  47.59 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  49.88 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  49.88 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  51.15 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  48.74 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  46.7 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  49.65 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  49.65 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2348  type II citrate synthase  49.41 
 
 		 428 aa  431  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729565  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  49.65 
 
 		 428 aa  431  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  49.65 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  49.41 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2199  type II citrate synthase  47.25 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  48.05 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1991  type II citrate synthase  49.06 
 
 		 433 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179438  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  51.3 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  47.82 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  53.2 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  49.29 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  53.45 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  47.02 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  53.55 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  48.24 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>