48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2567 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2567  nuclease  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  54.87 
 
 		 178 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  39.81 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  36.67 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  37.58 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1025  nuclease  40 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0861238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  31.78 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  36.52 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  46.05 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  34.78 
 
 		 192 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  33.03 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  27.78 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1330  nuclease  33.06 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  30.33 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.71 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.6 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  33.04 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  29.52 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  31.71 
 
 		 201 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  28.3 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  25.62 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  26.19 
 
 		 227 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  30.69 
 
 		 284 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  29.2 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  31.97 
 
 		 228 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  25.6 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  30.25 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  32.76 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  27.62 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  33.05 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  34.91 
 
 		 238 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  25.9 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 271 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  25 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  28.95 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  26.72 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  29.73 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  28.32 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  32.73 
 
 		 259 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  30.17 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  27.61 
 
 		 153 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  25.58 
 
 		 192 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  23.88 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  31.3 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  30.97 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  30.58 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  24.31 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  33.75 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>