121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2562 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1105    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  40.82 
 
 		 535 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  40.26 
 
 		 533 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  39.56 
 
 		 532 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  32.97 
 
 		 522 aa  233  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  30.43 
 
 		 520 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  28.6 
 
 		 537 aa  171  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  26.24 
 
 		 569 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  26.24 
 
 		 569 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  24.23 
 
 		 565 aa  103  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  22.41 
 
 		 712 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  30.43 
 
 		 1146 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  43.64 
 
 		 623 aa  54.3  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  30.36 
 
 		 695 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.06 
 
 		 666 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  45.83 
 
 		 1174 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  46 
 
 		 924 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  48 
 
 		 891 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  46 
 
 		 895 aa  51.6  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  20.37 
 
 		 607 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  31.63 
 
 		 1189 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  34.07 
 
 		 1209 aa  50.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 702 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.06 
 
 		 371 aa  50.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1187 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  26.67 
 
 		 703 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 		 1187 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  31.67 
 
 		 659 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  23.17 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1192 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1190 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1485  SMC domain protein  46.51 
 
 		 952 aa  48.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  30.16 
 
 		 1179 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  39.66 
 
 		 1201 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  32.04 
 
 		 1200 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1196 aa  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  37.88 
 
 		 1074 aa  47.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  26.83 
 
 		 581 aa  47.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  41.67 
 
 		 1191 aa  47.8  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  30.1 
 
 		 1134 aa  47.4  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  30.16 
 
 		 1186 aa  47.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  24.35 
 
 		 464 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  31.75 
 
 		 1177 aa  47.4  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  31.75 
 
 		 1190 aa  47.4  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  39.62 
 
 		 935 aa  47.4  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  41.67 
 
 		 1190 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  33.93 
 
 		 442 aa  47  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  46.51 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  26.95 
 
 		 596 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  32.69 
 
 		 1208 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  25.87 
 
 		 1208 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  41.38 
 
 		 789 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  30.3 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  36.73 
 
 		 1176 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00117  DNA repair ATPase  26.04 
 
 		 704 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 		 1177 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  35.8 
 
 		 922 aa  46.2  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  33.8 
 
 		 702 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  42 
 
 		 890 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  28.17 
 
 		 1185 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  35.42 
 
 		 1185 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  35.19 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  41.67 
 
 		 1189 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  37.5 
 
 		 1179 aa  45.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  41.67 
 
 		 1189 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  41.67 
 
 		 1189 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  41.67 
 
 		 1189 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  20.39 
 
 		 645 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  37.5 
 
 		 1176 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  41.67 
 
 		 1189 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  28.97 
 
 		 1225 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1189 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  35.42 
 
 		 1178 aa  45.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  47.06 
 
 		 987 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  41.67 
 
 		 1189 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  41.67 
 
 		 1189 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  41.67 
 
 		 1189 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  41.67 
 
 		 1189 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  47.06 
 
 		 987 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 		 1190 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  34.85 
 
 		 1080 aa  45.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  29.29 
 
 		 453 aa  44.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  38.33 
 
 		 1190 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  30 
 
 		 674 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  28.24 
 
 		 584 aa  44.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.46 
 
 		 689 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1181 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  33.82 
 
 		 1198 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  32.39 
 
 		 702 aa  44.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  27.03 
 
 		 1199 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  34.29 
 
 		 553 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  27.03 
 
 		 1199 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  52.94 
 
 		 553 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  39.58 
 
 		 1177 aa  44.3  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.57 
 
 		 637 aa  44.3  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  41.51 
 
 		 369 aa  44.3  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  34.04 
 
 		 586 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 		 1189 aa  44.3  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  39.53 
 
 		 339 aa  44.3  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  35.42 
 
 		 1185 aa  44.3  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>