More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2544 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  37.88 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  40.19 
 
 		 216 aa  138  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  36.95 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  36.19 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  35.75 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  36.14 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  35.32 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  38.24 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  36.63 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  34.29 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  32.34 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  33.17 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  32.7 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  34.01 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  34.15 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  28.7 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.63 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.17 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  26.09 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  28.5 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3311  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.79 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.01 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 328 aa  58.5  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  23.71 
 
 		 349 aa  58.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.37 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.63 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  33.11 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  23.53 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  28.42 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 309 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1705  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  30.09 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  30.09 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.75 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 259 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03717  SAM-dependent methyltransferase (Eurofung)  28.16 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0172981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  31.51 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.63 
 
 		 250 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  24.66 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  27.21 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 339 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.48 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 309 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4108  hypothetical protein  27.23 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4119  hypothetical protein  27.23 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0995588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  26.81 
 
 		 305 aa  52.4  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  25.42 
 
 		 312 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  33.07 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.46 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 250 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 251 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 243 aa  51.6  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.81 
 
 		 255 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  27.2 
 
 		 292 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  25.29 
 
 		 268 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0872  methyltransferase type 12  22.35 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00554243  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  24.51 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  32.63 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  29.73 
 
 		 250 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  26.76 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  25.79 
 
 		 242 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.21 
 
 		 272 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.35 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>