293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2535 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  100 
 
 
340 aa  707    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  58.41 
 
 
337 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  57.35 
 
 
337 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  56.81 
 
 
343 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  58.41 
 
 
337 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  57.94 
 
 
337 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  57.82 
 
 
337 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  57.82 
 
 
337 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  57.93 
 
 
354 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  59.19 
 
 
327 aa  418  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  56.2 
 
 
345 aa  418  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  58.57 
 
 
327 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  58.57 
 
 
327 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  58.57 
 
 
327 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  57.06 
 
 
337 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  54.71 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  55.59 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  55.14 
 
 
359 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  55.11 
 
 
364 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  54.6 
 
 
369 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  54.83 
 
 
370 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  53.42 
 
 
360 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  50.89 
 
 
368 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  56.65 
 
 
371 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  56.23 
 
 
373 aa  363  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  53.44 
 
 
378 aa  359  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  52.02 
 
 
370 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  51.24 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  56.51 
 
 
371 aa  338  5.9999999999999996e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  50 
 
 
368 aa  337  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  50.79 
 
 
363 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  50 
 
 
337 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  50 
 
 
337 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  50.47 
 
 
367 aa  329  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  52.55 
 
 
367 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  48.44 
 
 
324 aa  327  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  50.46 
 
 
365 aa  326  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  49.07 
 
 
325 aa  323  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  49.84 
 
 
348 aa  322  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  48.73 
 
 
327 aa  322  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  47.2 
 
 
369 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  49.69 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  47.84 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  47.84 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  47.84 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  49.69 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  49.26 
 
 
364 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  48.73 
 
 
347 aa  319  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  46.84 
 
 
339 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  48.89 
 
 
320 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  48.29 
 
 
320 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  48.29 
 
 
320 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  48.29 
 
 
320 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  48.29 
 
 
320 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  48.57 
 
 
425 aa  315  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  51.58 
 
 
328 aa  315  9e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  48.29 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  48.1 
 
 
348 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  48.59 
 
 
320 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  49.55 
 
 
364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  46.84 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  46.84 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  46.94 
 
 
367 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  49.37 
 
 
351 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  47.15 
 
 
339 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  47.47 
 
 
348 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  48.11 
 
 
320 aa  312  5.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  47.47 
 
 
348 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  46.62 
 
 
335 aa  309  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  46.75 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  45.51 
 
 
320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  48.9 
 
 
320 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  48.9 
 
 
320 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  48.9 
 
 
320 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  48.9 
 
 
320 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  48.25 
 
 
320 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  48.59 
 
 
320 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  48.59 
 
 
320 aa  305  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  48.92 
 
 
398 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  48.28 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  48.28 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  45.11 
 
 
370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  48.59 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  46.77 
 
 
371 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  45.11 
 
 
345 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  46.3 
 
 
344 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  46.6 
 
 
350 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  47.48 
 
 
354 aa  299  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  47.04 
 
 
370 aa  298  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  46.46 
 
 
371 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  44.24 
 
 
345 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  49.07 
 
 
354 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  45.11 
 
 
345 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  44.79 
 
 
345 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  46.5 
 
 
320 aa  295  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  43.79 
 
 
344 aa  294  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  47.44 
 
 
348 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  46.42 
 
 
367 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  45.99 
 
 
350 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  44.44 
 
 
370 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>