88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2530 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  52.78 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  49.71 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  47.4 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  45.86 
 
 		 178 aa  170  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  46.75 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  49.44 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  49.44 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  49.44 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  46.67 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  48.89 
 
 		 165 aa  167  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  44.44 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  49.44 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  43.58 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  46.15 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  46.37 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  45.56 
 
 		 191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  45.88 
 
 		 175 aa  157  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  49.07 
 
 		 161 aa  157  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  45.25 
 
 		 163 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  42.94 
 
 		 171 aa  155  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  45.56 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  44.97 
 
 		 187 aa  154  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  43.2 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  43.96 
 
 		 179 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  42.86 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  43.2 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  44.72 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  41.44 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  42.35 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  49.33 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  43.53 
 
 		 159 aa  141  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  49.24 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  37.64 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  32.93 
 
 		 157 aa  95.5  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  24.83 
 
 		 150 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  30.12 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  27.78 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  25.52 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  22.97 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  23.57 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  26.81 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  26.81 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  25.53 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  28.77 
 
 		 197 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  25.17 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  27.85 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  25.17 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  24.14 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  22.97 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  24.48 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  41.27 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  24.48 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  22.36 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  31.5 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  27.45 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  52.78 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  28.47 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  24.11 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  52.78 
 
 		 91 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  23.46 
 
 		 249 aa  45.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  22.7 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  23.24 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  21.09 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  24.48 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  26.21 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  22.07 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  26.53 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  22.38 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  25.87 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3203  hypothetical protein  22.56 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.936957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  26.17 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  28 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  26.17 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  22.08 
 
 		 258 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  23.7 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  25.23 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  37.78 
 
 		 76 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  28 
 
 		 151 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3368  transposase  24.84 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.863098  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  24.14 
 
 		 218 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  21.88 
 
 		 323 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  22.78 
 
 		 200 aa  41.2  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  24.14 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>