103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2515 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  100 
 
 
530 aa  1097    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  41.63 
 
 
543 aa  420  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.61 
 
 
528 aa  362  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.88 
 
 
526 aa  356  5.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  48 
 
 
552 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  47 
 
 
546 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  47.13 
 
 
498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.13 
 
 
498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  47.13 
 
 
506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  47.13 
 
 
498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  47.13 
 
 
498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  47.13 
 
 
498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  47.13 
 
 
498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  47.13 
 
 
498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  46.82 
 
 
498 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  47.08 
 
 
499 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  45.78 
 
 
499 aa  278  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  46.5 
 
 
498 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  46.5 
 
 
498 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  46.5 
 
 
498 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  51.4 
 
 
560 aa  277  4e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  47.19 
 
 
498 aa  276  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  43.22 
 
 
553 aa  276  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  46.18 
 
 
498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  45.91 
 
 
499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  48.96 
 
 
523 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  47.04 
 
 
553 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  46.6 
 
 
498 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  47.75 
 
 
468 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  45.08 
 
 
512 aa  266  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  47.4 
 
 
512 aa  266  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  47.4 
 
 
512 aa  266  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  43.81 
 
 
509 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  43.81 
 
 
509 aa  240  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  43.56 
 
 
489 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  38.76 
 
 
506 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  38.19 
 
 
498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  33.7 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.3 
 
 
375 aa  200  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  42.2 
 
 
466 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  39.35 
 
 
547 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  38.72 
 
 
464 aa  192  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.54 
 
 
389 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.61 
 
 
477 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.62 
 
 
407 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  35.5 
 
 
376 aa  154  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.33 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.09 
 
 
436 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.86 
 
 
383 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.79 
 
 
382 aa  136  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  32.45 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  36.88 
 
 
368 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  34.05 
 
 
368 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  38.67 
 
 
379 aa  97.8  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  27.78 
 
 
368 aa  96.7  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  38.67 
 
 
368 aa  95.9  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.1 
 
 
332 aa  53.5  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  23.27 
 
 
331 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  26.9 
 
 
324 aa  53.5  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.37 
 
 
333 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  29.27 
 
 
334 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.09 
 
 
318 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  26.09 
 
 
316 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  28.89 
 
 
334 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  21.91 
 
 
332 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.37 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  24.37 
 
 
335 aa  48.5  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  28.16 
 
 
320 aa  48.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  24.05 
 
 
340 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  26.34 
 
 
320 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  26.34 
 
 
320 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  23.64 
 
 
335 aa  47  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  22.22 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.92 
 
 
333 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25 
 
 
432 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  25.38 
 
 
356 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1976  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.98 
 
 
461 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0143  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.5 
 
 
449 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.65 
 
 
351 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  27.98 
 
 
309 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  27.43 
 
 
337 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  25.57 
 
 
369 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  22.76 
 
 
308 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.38 
 
 
350 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.7 
 
 
333 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.72 
 
 
302 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  25.68 
 
 
310 aa  45.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  23.21 
 
 
309 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  25.41 
 
 
318 aa  44.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  29.63 
 
 
607 aa  44.3  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.24 
 
 
456 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  24.1 
 
 
310 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  24.1 
 
 
310 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2965  ATPase  27.81 
 
 
298 aa  43.9  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.771332  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.29 
 
 
344 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  24.1 
 
 
310 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  24.7 
 
 
400 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  28.29 
 
 
334 aa  43.9  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  25.86 
 
 
330 aa  43.5  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.86 
 
 
330 aa  43.5  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>