More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2496 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  85.12 
 
 		 414 aa  718    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  100 
 
 		 408 aa  843    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  74.39 
 
 		 413 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  54.17 
 
 		 415 aa  441  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  54.88 
 
 		 415 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  54.95 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  53.9 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  54.41 
 
 		 408 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  52.68 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  51.71 
 
 		 422 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  54.7 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  53.88 
 
 		 412 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  52.62 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  52.25 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  51.71 
 
 		 416 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  53.1 
 
 		 413 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  52.22 
 
 		 409 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  53.11 
 
 		 418 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  49.75 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  50.63 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  51.35 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  48.02 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  51.11 
 
 		 411 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  51.11 
 
 		 411 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  46.19 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  44.39 
 
 		 409 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  43.64 
 
 		 410 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  45.43 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  45.12 
 
 		 413 aa  355  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  45.43 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  46.6 
 
 		 416 aa  351  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  43.55 
 
 		 413 aa  349  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  44.87 
 
 		 402 aa  348  7e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  46.38 
 
 		 416 aa  346  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  43.8 
 
 		 398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  43.65 
 
 		 403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  44.06 
 
 		 418 aa  335  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  42.64 
 
 		 399 aa  332  9e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  44.03 
 
 		 413 aa  322  6e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  41.4 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  41.4 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  41.4 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  40.65 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  39.33 
 
 		 391 aa  272  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  36.24 
 
 		 448 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  36.93 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  35.42 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  35.5 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  36.91 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  33.09 
 
 		 420 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  34.94 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  32.51 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  33.08 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  33.08 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  35.14 
 
 		 409 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  35.54 
 
 		 412 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  34.85 
 
 		 406 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  34.53 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  34.53 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  34.69 
 
 		 417 aa  233  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  35.31 
 
 		 397 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  32.84 
 
 		 404 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  33.42 
 
 		 404 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  33.42 
 
 		 404 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  33.33 
 
 		 449 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  35.03 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.84 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  33.66 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  33.76 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  31.51 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  32.19 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  34.18 
 
 		 396 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  31.73 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  34.03 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  32.92 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.27 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  34.34 
 
 		 406 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  33.59 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  33.42 
 
 		 421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  31.76 
 
 		 445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.66 
 
 		 422 aa  223  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  31.47 
 
 		 404 aa  223  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  33.17 
 
 		 428 aa  223  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.02 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  32.17 
 
 		 404 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  33.68 
 
 		 396 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  32.75 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  32.07 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  32.67 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  31.96 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  33.01 
 
 		 419 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  32.84 
 
 		 421 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  34.8 
 
 		 425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  33 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  33.25 
 
 		 404 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  32.49 
 
 		 401 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  35.11 
 
 		 402 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  33.42 
 
 		 410 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  33 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>