81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2480 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  629  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  35.71 
 
 		 272 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  32.25 
 
 		 782 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  31.33 
 
 		 746 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  34.8 
 
 		 813 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  29.6 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1580 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  32.07 
 
 		 848 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  28.81 
 
 		 986 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  29.39 
 
 		 1448 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1448 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  26.87 
 
 		 818 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  29.66 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  31.25 
 
 		 744 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  31.18 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  28.63 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  27.6 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  28.52 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000018393  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  28.52 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  29.76 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  29.37 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  27.96 
 
 		 357 aa  86.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  29.61 
 
 		 354 aa  85.9  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  29.61 
 
 		 621 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  30.11 
 
 		 778 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1495 aa  83.2  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  27.18 
 
 		 1255 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1077 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0611  Cpp22  24.55 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  27.6 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  28.39 
 
 		 736 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  28.51 
 
 		 777 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  28.74 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  27.15 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40670  DnaG-like primase protein  38.83 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  26.45 
 
 		 739 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  32.68 
 
 		 775 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  26.7 
 
 		 637 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  30.92 
 
 		 878 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  32.68 
 
 		 775 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  31.37 
 
 		 777 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  29.8 
 
 		 620 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  31.37 
 
 		 777 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  27.57 
 
 		 895 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  27.6 
 
 		 777 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  27.18 
 
 		 1557 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  27.52 
 
 		 1389 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.09 
 
 		 681 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.05 
 
 		 678 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  31.37 
 
 		 777 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  26.42 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  28.71 
 
 		 950 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.69 
 
 		 681 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  29.61 
 
 		 890 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  27.83 
 
 		 621 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  30.35 
 
 		 955 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  29.05 
 
 		 890 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  32.39 
 
 		 797 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  29.61 
 
 		 953 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  24.62 
 
 		 644 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  28.64 
 
 		 621 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  24.17 
 
 		 899 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  29.81 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  26.67 
 
 		 896 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  29.61 
 
 		 953 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  30.84 
 
 		 929 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  29.13 
 
 		 958 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  29.13 
 
 		 958 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  25.64 
 
 		 835 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  30.77 
 
 		 833 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  29.76 
 
 		 955 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  29.76 
 
 		 950 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  28.37 
 
 		 615 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  30.32 
 
 		 615 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  30.32 
 
 		 615 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  23.86 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  27.59 
 
 		 763 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  27.59 
 
 		 763 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  24.63 
 
 		 523 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3668  integrase family protein  27.59 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>