61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2457 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 889 aa  1853    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.2 
 
 		 1034 aa  117  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 626 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.78 
 
 		 378 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.49 
 
 		 628 aa  115  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.69 
 
 		 1034 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  32.83 
 
 		 403 aa  112  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.49 
 
 		 428 aa  111  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.13 
 
 		 632 aa  108  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.39 
 
 		 439 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.8 
 
 		 1074 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  30.54 
 
 		 606 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  33.02 
 
 		 429 aa  95.1  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  27.59 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.1 
 
 		 563 aa  78.2  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.11 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.12 
 
 		 432 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.03 
 
 		 773 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.19 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.89 
 
 		 440 aa  73.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  24.09 
 
 		 815 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  31.16 
 
 		 821 aa  71.2  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.81 
 
 		 824 aa  71.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  28.57 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.83 
 
 		 446 aa  70.5  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.08 
 
 		 1061 aa  69.3  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.04 
 
 		 557 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 559 aa  67.4  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.43 
 
 		 553 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  24 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  23.83 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.4 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.4 
 
 		 568 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  27.75 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.53 
 
 		 414 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.53 
 
 		 414 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.53 
 
 		 414 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.83 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.89 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.57 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  32.56 
 
 		 1067 aa  55.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.37 
 
 		 837 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1727  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.08 
 
 		 573 aa  51.2  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.79 
 
 		 393 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.68 
 
 		 557 aa  47.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1632  Fibronectin type III domain protein  43.55 
 
 		 377 aa  47.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.47 
 
 		 365 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  26.59 
 
 		 340 aa  47  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  29.94 
 
 		 340 aa  46.6  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  32.58 
 
 		 464 aa  47  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2126  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.08 
 
 		 619 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  27.22 
 
 		 344 aa  46.6  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.71 
 
 		 262 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  23.74 
 
 		 365 aa  45.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  24.88 
 
 		 356 aa  45.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  26.16 
 
 		 344 aa  45.8  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.71 
 
 		 453 aa  45.8  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.48 
 
 		 361 aa  45.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1698  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.07 
 
 		 999 aa  44.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  31.88 
 
 		 1695 aa  44.3  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  28 
 
 		 304 aa  44.3  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>