274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2423 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  100 
 
 		 411 aa  845    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  48.01 
 
 		 408 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  47.15 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  46.4 
 
 		 411 aa  356  5e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  46.8 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  46.21 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  46.21 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  45.84 
 
 		 431 aa  343  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.48 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  45.71 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.07 
 
 		 424 aa  333  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  47.61 
 
 		 416 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.97 
 
 		 420 aa  330  4e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  46.46 
 
 		 416 aa  325  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  45.73 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  43.52 
 
 		 420 aa  322  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  43.77 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  44.8 
 
 		 417 aa  316  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  42.86 
 
 		 433 aa  315  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  43.67 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  44.8 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  42.26 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  41.91 
 
 		 409 aa  292  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  44.04 
 
 		 418 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  40.69 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  40.05 
 
 		 415 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.8 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  42.18 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.79 
 
 		 589 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.4 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.28 
 
 		 589 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  40.1 
 
 		 591 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40 
 
 		 593 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  41.63 
 
 		 429 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.35 
 
 		 591 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  38.96 
 
 		 409 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  38.96 
 
 		 409 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.44 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.51 
 
 		 599 aa  259  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.48 
 
 		 599 aa  259  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  40.71 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.54 
 
 		 592 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.69 
 
 		 592 aa  249  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.49 
 
 		 592 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.85 
 
 		 594 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  36.67 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  36.5 
 
 		 412 aa  230  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.5 
 
 		 415 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.91 
 
 		 430 aa  215  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  33.98 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.5 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.16 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.66 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  35.48 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.29 
 
 		 426 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.56 
 
 		 426 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  33.83 
 
 		 422 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  32.92 
 
 		 415 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  35.34 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  32.91 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  31.89 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.32 
 
 		 421 aa  206  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.33 
 
 		 430 aa  206  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  32.93 
 
 		 442 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  33.33 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  34.11 
 
 		 426 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  34.11 
 
 		 426 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  33.59 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  33.59 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  31.64 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  31.64 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  31.64 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  34.69 
 
 		 430 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  31.42 
 
 		 421 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  32.32 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.95 
 
 		 401 aa  201  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  33.93 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  32.37 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  33.83 
 
 		 419 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  33.01 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  31.05 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  31.78 
 
 		 418 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.47 
 
 		 447 aa  199  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 431 aa  199  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  36.24 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  36.24 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  34.43 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  32.6 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.15 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  34.39 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4007  allantoate amidohydrolase  32.4 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.44 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.29 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  30.81 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  30.99 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.29 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>