More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2417 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2417  amidase  100 
 
 		 600 aa  1236    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0417  amidase  81.55 
 
 		 437 aa  659    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0350631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  50.25 
 
 		 611 aa  565  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  49.75 
 
 		 611 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  48.91 
 
 		 597 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  50.17 
 
 		 603 aa  559  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  48.84 
 
 		 607 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  49 
 
 		 601 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  49.42 
 
 		 625 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  46.89 
 
 		 601 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  44.7 
 
 		 614 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  44.97 
 
 		 599 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  45.55 
 
 		 599 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  44.72 
 
 		 600 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  43.17 
 
 		 596 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  47.04 
 
 		 616 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  44.75 
 
 		 604 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  42.54 
 
 		 598 aa  457  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  44.41 
 
 		 631 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  43.26 
 
 		 601 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  43.23 
 
 		 607 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  44.52 
 
 		 597 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  42.5 
 
 		 601 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  43.6 
 
 		 600 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  43.42 
 
 		 628 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  43.71 
 
 		 609 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  46.69 
 
 		 600 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  43.78 
 
 		 596 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  43.49 
 
 		 621 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  44.3 
 
 		 599 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  41.07 
 
 		 598 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  47.98 
 
 		 606 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  43.65 
 
 		 601 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  41.22 
 
 		 621 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  42.67 
 
 		 633 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  43.44 
 
 		 618 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  44.09 
 
 		 600 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  43.52 
 
 		 609 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  43.12 
 
 		 596 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  44.99 
 
 		 601 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  38.85 
 
 		 609 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  38.99 
 
 		 604 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  38.18 
 
 		 590 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  44.79 
 
 		 623 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  44.48 
 
 		 623 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  38.69 
 
 		 604 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  41.91 
 
 		 601 aa  392  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  43.25 
 
 		 576 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  42.44 
 
 		 1822 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  43.04 
 
 		 589 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  44.34 
 
 		 569 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  44.13 
 
 		 588 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  37.58 
 
 		 624 aa  365  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  38.49 
 
 		 620 aa  363  4e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  38.79 
 
 		 569 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  45.23 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  37.31 
 
 		 565 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6163  amidase  39.96 
 
 		 456 aa  317  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1385  putative urea amidolyase  43.07 
 
 		 502 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209103  normal  0.0685044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1484  amidase  39.02 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5227  allophanate hydrolase  44.27 
 
 		 484 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  37.89 
 
 		 578 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  37.89 
 
 		 578 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  37.89 
 
 		 578 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0675  amidase  38.17 
 
 		 523 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  39.39 
 
 		 553 aa  300  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  38.23 
 
 		 554 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  38.2 
 
 		 603 aa  280  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3052  amidase  40.54 
 
 		 467 aa  277  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242622  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  37.52 
 
 		 572 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  38.17 
 
 		 595 aa  270  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  34.65 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  35.71 
 
 		 627 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2764  amidase  39.22 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2808  amidase  39.22 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1891  Urea carboxylase  47.03 
 
 		 248 aa  209  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1114  Urea carboxylase  47.03 
 
 		 248 aa  209  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.17 
 
 		 483 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  31.14 
 
 		 449 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  30.32 
 
 		 463 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.91 
 
 		 479 aa  150  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  31.39 
 
 		 458 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  30.18 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  29.68 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  27.78 
 
 		 456 aa  145  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  29.76 
 
 		 449 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.32 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  31.19 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.42 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  32.01 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.06 
 
 		 483 aa  139  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.47 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.56 
 
 		 475 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  33.24 
 
 		 450 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  31.27 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  30.28 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  35.17 
 
 		 509 aa  135  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  30 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0979  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.15 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  29.65 
 
 		 456 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>